More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0097 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  100 
 
 		 465 aa  910    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  64.58 
 
 		 482 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  64.58 
 
 		 482 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  64.58 
 
 		 483 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  65.07 
 
 		 483 aa  577  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  65.37 
 
 		 490 aa  570  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  57.33 
 
 		 476 aa  525  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  53.16 
 
 		 476 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  43.94 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  43.8 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  41 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  41.97 
 
 		 463 aa  344  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  36.13 
 
 		 467 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  36.13 
 
 		 467 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  36.13 
 
 		 467 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  36.13 
 
 		 467 aa  289  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  35.91 
 
 		 467 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  35.7 
 
 		 467 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  36.2 
 
 		 467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  37.5 
 
 		 471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  37.5 
 
 		 471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  36.21 
 
 		 467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  36.65 
 
 		 486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  36.21 
 
 		 467 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  37.07 
 
 		 471 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  37.07 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  35.13 
 
 		 467 aa  279  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  35.4 
 
 		 500 aa  276  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  39.86 
 
 		 518 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  34.91 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  33.76 
 
 		 489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  40.88 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  36.32 
 
 		 506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  35.9 
 
 		 476 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  37.84 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  32.76 
 
 		 471 aa  263  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  38.16 
 
 		 495 aa  263  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  32.4 
 
 		 471 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  35.08 
 
 		 478 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  32.18 
 
 		 490 aa  260  4e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  35.9 
 
 		 476 aa  259  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  32.11 
 
 		 471 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  36.49 
 
 		 481 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  36.26 
 
 		 506 aa  257  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  32.33 
 
 		 471 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  32.33 
 
 		 471 aa  256  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  32.33 
 
 		 471 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  32.33 
 
 		 471 aa  256  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  32.33 
 
 		 471 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  32.33 
 
 		 471 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  32.75 
 
 		 471 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  32.75 
 
 		 471 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  32.75 
 
 		 471 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  32.33 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  34.66 
 
 		 503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  32.97 
 
 		 471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  32.26 
 
 		 471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  33.91 
 
 		 488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 549 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  36.12 
 
 		 476 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  32.75 
 
 		 471 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  33.19 
 
 		 486 aa  252  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  32.75 
 
 		 471 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  32.75 
 
 		 471 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  33.19 
 
 		 486 aa  252  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  32.2 
 
 		 480 aa  252  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  34.84 
 
 		 463 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  35.06 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  32.75 
 
 		 471 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  34.19 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 520 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  36.6 
 
 		 466 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  34.84 
 
 		 463 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  35.08 
 
 		 478 aa  250  4e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  35.04 
 
 		 465 aa  250  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  36.5 
 
 		 471 aa  249  9e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  32.75 
 
 		 471 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  33.55 
 
 		 483 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  34.07 
 
 		 496 aa  249  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  33.68 
 
 		 492 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  33.81 
 
 		 515 aa  247  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 		 496 aa  247  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  35.6 
 
 		 468 aa  247  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 		 496 aa  247  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  34.38 
 
 		 494 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 495 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  32.91 
 
 		 486 aa  244  3e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  32.7 
 
 		 512 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  33.55 
 
 		 481 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  32.93 
 
 		 566 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  31.76 
 
 		 467 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  35.6 
 
 		 466 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  32.59 
 
 		 464 aa  242  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  32.21 
 
 		 482 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  33.05 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  35.35 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  34.58 
 
 		 501 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  35.13 
 
 		 468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  35.13 
 
 		 468 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  35.13 
 
 		 468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>