More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1808 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  100 
 
 		 465 aa  912    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  59.78 
 
 		 466 aa  558  1e-158  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  49.03 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  52.46 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  49.78 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  47.76 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  44.09 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  44.09 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  43.74 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  43.8 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  41.97 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  45.63 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  41.97 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  41.11 
 
 		 471 aa  362  8e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  41.97 
 
 		 471 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  41.76 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  41.76 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  41.76 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  41.76 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  41.76 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  41.76 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  42.43 
 
 		 471 aa  359  5e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  44.52 
 
 		 467 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  42.43 
 
 		 471 aa  359  5e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  44.52 
 
 		 467 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  42.43 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  40.04 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  40.04 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  40.04 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  44.52 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  42.22 
 
 		 471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  42.77 
 
 		 489 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  44.3 
 
 		 467 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  44.09 
 
 		 467 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  44.3 
 
 		 467 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  44.3 
 
 		 467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  44.3 
 
 		 467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  43.46 
 
 		 483 aa  352  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  39.61 
 
 		 471 aa  352  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  41.33 
 
 		 471 aa  352  8e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  44.3 
 
 		 467 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  39.83 
 
 		 471 aa  349  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  39.83 
 
 		 471 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  42.86 
 
 		 476 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  40.47 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  39.83 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  44.09 
 
 		 467 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  39.61 
 
 		 471 aa  346  6e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  39.83 
 
 		 483 aa  343  4e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  42.46 
 
 		 490 aa  343  4e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  41.58 
 
 		 471 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  40.64 
 
 		 500 aa  342  8e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  44.2 
 
 		 460 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  39.61 
 
 		 496 aa  340  4e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  36.82 
 
 		 490 aa  325  1e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  42.92 
 
 		 495 aa  324  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  40.22 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  40.38 
 
 		 501 aa  319  9e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  37.61 
 
 		 486 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  37.61 
 
 		 486 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  38.49 
 
 		 549 aa  315  8e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  40.26 
 
 		 491 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  36.97 
 
 		 506 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  38.51 
 
 		 476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  41.16 
 
 		 466 aa  313  4.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  39.91 
 
 		 491 aa  312  6.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  37.93 
 
 		 518 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  37.98 
 
 		 486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  40.08 
 
 		 492 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  39.35 
 
 		 488 aa  307  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  35.85 
 
 		 496 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  35.85 
 
 		 496 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  37.25 
 
 		 456 aa  306  6e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  38.43 
 
 		 520 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  37.56 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  36.92 
 
 		 494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  37.4 
 
 		 515 aa  302  9e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  39.78 
 
 		 476 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  38.33 
 
 		 468 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  38.72 
 
 		 469 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  34.69 
 
 		 495 aa  299  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  36.97 
 
 		 566 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  39.79 
 
 		 478 aa  298  2e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  39.69 
 
 		 465 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  38.35 
 
 		 504 aa  296  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  37.98 
 
 		 500 aa  295  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  38 
 
 		 496 aa  295  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  37.79 
 
 		 476 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  35.85 
 
 		 496 aa  293  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  38.19 
 
 		 499 aa  292  7e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  36.94 
 
 		 515 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  36.63 
 
 		 516 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  40.18 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  38.09 
 
 		 486 aa  290  4e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  40.31 
 
 		 466 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  39.36 
 
 		 466 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  39.15 
 
 		 468 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  39.15 
 
 		 468 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  39.15 
 
 		 468 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  39.18 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>