More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1827 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  100 
 
 		 480 aa  946    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  72.15 
 
 		 475 aa  649    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  98.33 
 
 		 480 aa  932    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  77.4 
 
 		 543 aa  697    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2328  amino acid permease-associated region  65.17 
 
 		 467 aa  522  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205758  normal  0.251139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  59.45 
 
 		 478 aa  511  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1704  amino acid permease-associated region  63.79 
 
 		 465 aa  514  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4411  amino acid permease-associated region  64.81 
 
 		 470 aa  501  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528194  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2372  amino acid permease-associated region  65.17 
 
 		 467 aa  490  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2649  amino acid permease-associated region  65.44 
 
 		 467 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.925431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  45.85 
 
 		 525 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  47.92 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  44.78 
 
 		 518 aa  392  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  42.47 
 
 		 539 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2567  amino acid permease-associated region  46.98 
 
 		 507 aa  364  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  43.62 
 
 		 476 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  44.37 
 
 		 476 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  42.08 
 
 		 467 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  42.94 
 
 		 489 aa  355  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  41.88 
 
 		 467 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  41.88 
 
 		 467 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  41.88 
 
 		 467 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 		 506 aa  355  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  44.52 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  44.52 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  42.29 
 
 		 467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  41.88 
 
 		 467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  44.49 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  44.3 
 
 		 466 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  41.67 
 
 		 467 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  41.67 
 
 		 467 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  44.23 
 
 		 468 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  44.23 
 
 		 468 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  40.67 
 
 		 471 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  40.67 
 
 		 471 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  40.67 
 
 		 471 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  40.88 
 
 		 471 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  43.86 
 
 		 468 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  40.67 
 
 		 471 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  40.67 
 
 		 471 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  44.07 
 
 		 468 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  44.49 
 
 		 466 aa  349  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  44.82 
 
 		 476 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  40.46 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  41.67 
 
 		 467 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  42.55 
 
 		 476 aa  348  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  44.49 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  44.49 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  44.49 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  41.09 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  41.46 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  39.62 
 
 		 471 aa  346  7e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  44.28 
 
 		 467 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  44.28 
 
 		 467 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  44.28 
 
 		 467 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  44.28 
 
 		 467 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  44.28 
 
 		 467 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  39.83 
 
 		 471 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  43.37 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  42.53 
 
 		 488 aa  343  5e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  43.97 
 
 		 465 aa  339  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  39.03 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  39.03 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  39.03 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  40.92 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  39.87 
 
 		 549 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  40.46 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  42.37 
 
 		 465 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  41.04 
 
 		 483 aa  336  5e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  41.72 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  43.31 
 
 		 469 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  41.72 
 
 		 500 aa  334  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  42.48 
 
 		 486 aa  333  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  42.48 
 
 		 486 aa  333  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  39.35 
 
 		 495 aa  333  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  38.4 
 
 		 471 aa  332  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  39.66 
 
 		 471 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  40.69 
 
 		 496 aa  332  9e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  39.45 
 
 		 471 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  42.26 
 
 		 480 aa  331  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  39.45 
 
 		 471 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  43.01 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 		 491 aa  331  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  39.45 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  39.1 
 
 		 486 aa  329  7e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  39.24 
 
 		 471 aa  328  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  41.98 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  43.69 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  39.8 
 
 		 494 aa  322  7e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  43.63 
 
 		 481 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  41.74 
 
 		 471 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  41.74 
 
 		 471 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  41.3 
 
 		 471 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  42.8 
 
 		 463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  41.09 
 
 		 471 aa  319  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  38.62 
 
 		 486 aa  319  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  42.24 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  41.1 
 
 		 460 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  43.58 
 
 		 482 aa  317  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0344  amino acid permease family protein  47.64 
 
 		 465 aa  316  6e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>