More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1961 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 469 aa  936    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  77.92 
 
 		 499 aa  748    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  60.55 
 
 		 473 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  61.86 
 
 		 474 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  60.08 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  51.69 
 
 		 490 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  48.17 
 
 		 522 aa  425  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  35.53 
 
 		 489 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  32.61 
 
 		 461 aa  246  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  31.36 
 
 		 485 aa  237  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  31.91 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  34.79 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  34.85 
 
 		 495 aa  223  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  32.61 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  32.41 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  31.03 
 
 		 484 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  29.3 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  29.3 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  30.85 
 
 		 443 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  30.98 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  34.23 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  29.98 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  29.98 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  29.62 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  29.98 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  29.98 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  30.19 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  29.98 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  29.98 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  29.98 
 
 		 438 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  29.91 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  29.35 
 
 		 467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 463 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 482 aa  159  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  28.78 
 
 		 443 aa  159  7e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 		 448 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  25.11 
 
 		 458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  27.7 
 
 		 452 aa  150  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 453 aa  146  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  30.17 
 
 		 387 aa  146  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  26.58 
 
 		 480 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  26.05 
 
 		 580 aa  139  7.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  25.41 
 
 		 609 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 454 aa  126  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.35 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.45 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  24.78 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.45 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.24 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.24 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.24 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.24 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.24 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  27.99 
 
 		 440 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  26.54 
 
 		 462 aa  114  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.9 
 
 		 463 aa  113  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  26.75 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.12 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.12 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  26.75 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  26.29 
 
 		 537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  26.69 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.58 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  26.69 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  26 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  26.75 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  26.75 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 466 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  24.74 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.45 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.45 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  24.95 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.25 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  26.25 
 
 		 541 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.45 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  26.4 
 
 		 541 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  26.25 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 445 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.16 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  25.79 
 
 		 664 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.95 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.95 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>