More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04430 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  100 
 
 		 580 aa  1169    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  40.39 
 
 		 609 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  32.94 
 
 		 485 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  34.81 
 
 		 473 aa  200  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08538  amino acid transporter (Eurofung)  31.87 
 
 		 507 aa  192  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  33.09 
 
 		 452 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  31.13 
 
 		 467 aa  183  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 461 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  26.02 
 
 		 522 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  29.23 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  28.86 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  30.49 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 443 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 499 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  28.07 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  28.29 
 
 		 484 aa  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  27.77 
 
 		 489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 		 490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 447 aa  146  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  26.96 
 
 		 452 aa  146  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 473 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 448 aa  144  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  25.49 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  27.09 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  27.09 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  27.09 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  27.09 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  26.93 
 
 		 437 aa  134  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  26.81 
 
 		 437 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  26.71 
 
 		 438 aa  133  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  26.87 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  29.2 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 437 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  29.96 
 
 		 452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  24.62 
 
 		 452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10319  amino acid transporter (Eurofung)  29.41 
 
 		 514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02560  methionine transporter, putative (Eurofung)  28.4 
 
 		 560 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.503958 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28954  very low affinity methionine permease  25.84 
 
 		 550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144807  normal  0.597745 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  26.11 
 
 		 440 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01631  methionine transporter (Eurofung)  24.76 
 
 		 540 aa  117  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.281549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 		 472 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 444 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 		 770 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  27.94 
 
 		 440 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 466 aa  109  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69488  high affinity methionine permease  25.44 
 
 		 551 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.649926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 495 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  27.55 
 
 		 445 aa  103  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 496 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 496 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  30.54 
 
 		 452 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  26.74 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 442 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  26.94 
 
 		 462 aa  101  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  26.94 
 
 		 462 aa  101  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 576 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  27.06 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  27.06 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 500 aa  100  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 		 506 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  24.33 
 
 		 480 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  26.84 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 518 aa  97.8  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 		 786 aa  97.8  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  28.72 
 
 		 472 aa  97.8  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  22.95 
 
 		 452 aa  97.8  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 544 aa  97.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  25.32 
 
 		 426 aa  97.1  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  24.94 
 
 		 431 aa  97.1  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  24.94 
 
 		 431 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  27.29 
 
 		 446 aa  97.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 		 452 aa  97.1  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 		 467 aa  96.7  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  29.38 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 745 aa  96.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  26.51 
 
 		 474 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  24.39 
 
 		 520 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 764 aa  95.1  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  26.01 
 
 		 387 aa  94  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 441 aa  94  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 495 aa  94  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 439 aa  93.6  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  23.14 
 
 		 496 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 488 aa  93.2  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  25.35 
 
 		 543 aa  92.8  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  22.02 
 
 		 524 aa  92.4  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  25.75 
 
 		 480 aa  91.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>