More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2592 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 452 aa  902    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0924  amino acid permease-associated region  67.33 
 
 		 449 aa  615  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  34.14 
 
 		 443 aa  242  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 442 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1589  amino acid permease, putative  31.03 
 
 		 450 aa  166  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000140221  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  26.39 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 435 aa  140  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  27.57 
 
 		 438 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  27.57 
 
 		 438 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  27.57 
 
 		 438 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  27.57 
 
 		 438 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  27.57 
 
 		 438 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  27.57 
 
 		 437 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  27.57 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  27.34 
 
 		 437 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 443 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  29.94 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  29.71 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  29.71 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  28.36 
 
 		 387 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  22.95 
 
 		 580 aa  92.8  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  23.23 
 
 		 482 aa  83.2  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  28.4 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  23.38 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  26.4 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  26.07 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  22.9 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  25.91 
 
 		 485 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl605  putative amino acid/amine (lysine) APC transporter  24.36 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  23.14 
 
 		 528 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  28.13 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 473 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 555 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  24.53 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  22.44 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  21.25 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  24.24 
 
 		 517 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  21.86 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  21.75 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 530 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  25 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  23.4 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  24.08 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  22.98 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl664  putrescine/ornithine APC transporter  25.26 
 
 		 577 aa  63.9  0.000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  22.98 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  22.98 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  23.9 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  23.9 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  23.9 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  23.9 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0458  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518173  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  24.68 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 543 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  24.63 
 
 		 786 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  26.47 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  26.47 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  23.01 
 
 		 559 aa  62  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 		 529 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  26.47 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  26.47 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  26.47 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  26.47 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  26.05 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  22.54 
 
 		 544 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 770 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  24.85 
 
 		 609 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  23.84 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  24.72 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  23.45 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  23.45 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 		 576 aa  60.1  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  23.32 
 
 		 528 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  22.41 
 
 		 543 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  26.46 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf753  amino acid permease  26.22 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  21.59 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  22.75 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  21.43 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  23.93 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  22.69 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>