More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2343 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 454 aa  895    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  40.36 
 
 		 467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  40.53 
 
 		 452 aa  299  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  38.16 
 
 		 448 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  38.28 
 
 		 452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  32.29 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  30.05 
 
 		 452 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  28.84 
 
 		 485 aa  143  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  32.29 
 
 		 473 aa  142  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  28.29 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  27.46 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 469 aa  136  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  26.92 
 
 		 489 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  29.19 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  30.05 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  29.81 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 490 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 440 aa  126  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 440 aa  126  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  26.95 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  25.6 
 
 		 580 aa  118  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 447 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  28.43 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  23.44 
 
 		 522 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 764 aa  107  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 		 382 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 463 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 495 aa  97.1  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 463 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 457 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  24.59 
 
 		 609 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  26.12 
 
 		 480 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  28.34 
 
 		 473 aa  94  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 494 aa  94  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.21 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 436 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.11 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 496 aa  86.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  24.37 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  28.91 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 538 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  25.93 
 
 		 525 aa  84  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  25.67 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  25.93 
 
 		 518 aa  83.6  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  28.07 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 786 aa  81.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  22.88 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  24.88 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  27.14 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 506 aa  80.1  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  23.83 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  28.4 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  28.88 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  28.4 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  22.94 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  22.94 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  22.94 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  22.94 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 		 792 aa  79  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  22.94 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  23.57 
 
 		 512 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  25.14 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  23.15 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  23.15 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  23.15 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  22.05 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  22.72 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  22.72 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  23.16 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  25.1 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  21.09 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 745 aa  76.6  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  24.61 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  29.81 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 716 aa  75.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>