More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6226 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 490 aa  970    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  51.69 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  52.72 
 
 		 473 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  48.71 
 
 		 499 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  50.3 
 
 		 522 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  53.46 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  53.36 
 
 		 474 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  33.95 
 
 		 489 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  34.65 
 
 		 461 aa  249  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  31.01 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  33.12 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  32.76 
 
 		 439 aa  219  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  37.27 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  31.36 
 
 		 452 aa  217  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  30.93 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  31.54 
 
 		 484 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 440 aa  180  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 440 aa  180  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  32.53 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  31.38 
 
 		 463 aa  177  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  28.04 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 448 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  29.63 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  30.95 
 
 		 447 aa  167  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 		 447 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  29.08 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  27.51 
 
 		 609 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  28.9 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  28.9 
 
 		 437 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  28.9 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  28.9 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  28.9 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  28.69 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  28.9 
 
 		 438 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  28.69 
 
 		 438 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  27.11 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  27.2 
 
 		 580 aa  144  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 382 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 442 aa  133  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  28.77 
 
 		 451 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  26.4 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  30.23 
 
 		 451 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  27.38 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  24.83 
 
 		 480 aa  120  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 452 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  27.13 
 
 		 541 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 474 aa  113  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 543 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.42 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.68 
 
 		 471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.42 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.22 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.22 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.22 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.22 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  27.6 
 
 		 541 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.22 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 541 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  26.32 
 
 		 541 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  26.7 
 
 		 666 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 457 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 427 aa  109  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 		 467 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  26.32 
 
 		 664 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 786 aa  108  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.1 
 
 		 490 aa  107  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  25.97 
 
 		 426 aa  107  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 537 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.67 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 476 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  28.32 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.03 
 
 		 471 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.83 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  26.15 
 
 		 519 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  26.21 
 
 		 463 aa  105  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  26.29 
 
 		 463 aa  105  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.03 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.88 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.52 
 
 		 467 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  27.09 
 
 		 537 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.52 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.83 
 
 		 467 aa  104  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>