More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2309 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  88.04 
 
 		 537 aa  917    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  81.19 
 
 		 541 aa  822    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  67.88 
 
 		 528 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  78.12 
 
 		 541 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  75.24 
 
 		 519 aa  773    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  80.38 
 
 		 541 aa  815    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  75.24 
 
 		 642 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  78.12 
 
 		 664 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 543 aa  1070    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  78.31 
 
 		 666 aa  818    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  81 
 
 		 541 aa  822    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  79.65 
 
 		 541 aa  832    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  87.71 
 
 		 537 aa  919    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  81 
 
 		 541 aa  820    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  60.73 
 
 		 522 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  76.01 
 
 		 521 aa  766    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  88.64 
 
 		 537 aa  927    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  81.19 
 
 		 541 aa  822    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  80.77 
 
 		 541 aa  821    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  75.24 
 
 		 642 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  80.77 
 
 		 541 aa  817    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  56.24 
 
 		 529 aa  618  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  37.66 
 
 		 544 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  37.66 
 
 		 576 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  40.7 
 
 		 530 aa  355  7.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  38.04 
 
 		 517 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  38.72 
 
 		 533 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  38.72 
 
 		 533 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  38.72 
 
 		 533 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  36.69 
 
 		 555 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  36.38 
 
 		 543 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  38.3 
 
 		 533 aa  347  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  38.68 
 
 		 533 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  38.68 
 
 		 533 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  38.68 
 
 		 533 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  38.68 
 
 		 533 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  37.77 
 
 		 546 aa  345  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  36.73 
 
 		 541 aa  344  2e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  36.93 
 
 		 530 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  37.12 
 
 		 532 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  37.62 
 
 		 532 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  37 
 
 		 543 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  36.17 
 
 		 532 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  35.48 
 
 		 528 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  35.29 
 
 		 528 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  37.31 
 
 		 532 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  37.31 
 
 		 532 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  37.31 
 
 		 532 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  36.17 
 
 		 532 aa  326  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  36.56 
 
 		 516 aa  302  8.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  33.77 
 
 		 536 aa  293  7e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  32.53 
 
 		 545 aa  289  8e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  35.6 
 
 		 525 aa  289  8e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  32.53 
 
 		 545 aa  289  8e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  35.4 
 
 		 518 aa  287  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  35.61 
 
 		 530 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  35.92 
 
 		 546 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  33.66 
 
 		 559 aa  281  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  35.97 
 
 		 537 aa  269  8.999999999999999e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  35.53 
 
 		 533 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  34.07 
 
 		 539 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  34.07 
 
 		 539 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  30.92 
 
 		 616 aa  262  1e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  33.69 
 
 		 533 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  32.16 
 
 		 521 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  33.4 
 
 		 539 aa  252  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 539 aa  252  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  31.75 
 
 		 630 aa  251  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  31.58 
 
 		 491 aa  249  9e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  31.89 
 
 		 560 aa  247  4.9999999999999997e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  30.92 
 
 		 528 aa  246  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  30.92 
 
 		 528 aa  246  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  31.89 
 
 		 560 aa  246  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  34.26 
 
 		 531 aa  242  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  33.48 
 
 		 635 aa  240  5e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  29.87 
 
 		 535 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  30.9 
 
 		 542 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  31.2 
 
 		 542 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  32.74 
 
 		 614 aa  223  7e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  31.43 
 
 		 535 aa  222  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  32.84 
 
 		 647 aa  218  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  28.77 
 
 		 518 aa  212  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 576 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  31.37 
 
 		 511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  30.57 
 
 		 514 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 539 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  31.1 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  31.47 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  31 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  30.79 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  30.79 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  30.79 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  30.79 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  30.79 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  30.79 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  30.79 
 
 		 471 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  29.67 
 
 		 471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 522 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>