More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6568 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  100 
 
 		 533 aa  1041    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  45.33 
 
 		 528 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  45.33 
 
 		 528 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  47.42 
 
 		 539 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  47.42 
 
 		 539 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  43.23 
 
 		 539 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  43.23 
 
 		 539 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  45.44 
 
 		 537 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  39.85 
 
 		 525 aa  357  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  39.88 
 
 		 518 aa  357  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  37.24 
 
 		 541 aa  325  1e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  40.86 
 
 		 546 aa  320  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  36.4 
 
 		 555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  37.62 
 
 		 576 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  36.47 
 
 		 546 aa  302  9e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  37.45 
 
 		 544 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  37.75 
 
 		 543 aa  300  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  36.66 
 
 		 530 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  38.13 
 
 		 517 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  37.3 
 
 		 543 aa  297  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  37.2 
 
 		 533 aa  297  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  32.96 
 
 		 560 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  32.96 
 
 		 560 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  34.1 
 
 		 521 aa  292  8e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  37.03 
 
 		 533 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  37.03 
 
 		 533 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  37.03 
 
 		 533 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  35.03 
 
 		 531 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  36.52 
 
 		 532 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  36.84 
 
 		 533 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  36.84 
 
 		 533 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  36.84 
 
 		 533 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  36.84 
 
 		 533 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  32.44 
 
 		 535 aa  286  7e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  32.63 
 
 		 535 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  36.84 
 
 		 532 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  36.63 
 
 		 532 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  33.21 
 
 		 528 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  31.62 
 
 		 542 aa  280  4e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  33.02 
 
 		 528 aa  279  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  37.11 
 
 		 532 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  31.43 
 
 		 542 aa  276  8e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  32.29 
 
 		 529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 530 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  35.71 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  35.71 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  35.71 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  33.8 
 
 		 543 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  34.52 
 
 		 537 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  36.24 
 
 		 533 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  34.52 
 
 		 537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  34.06 
 
 		 537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  35.77 
 
 		 518 aa  270  4e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  37.82 
 
 		 516 aa  269  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  32.67 
 
 		 521 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  33.9 
 
 		 528 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  32.78 
 
 		 541 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  33.12 
 
 		 541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  32.78 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  32.92 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  32.92 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  32.78 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  33.95 
 
 		 635 aa  252  1e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  35.27 
 
 		 530 aa  251  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  34.17 
 
 		 616 aa  249  6e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  31.31 
 
 		 541 aa  249  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  32.37 
 
 		 541 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  30.94 
 
 		 541 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  31.14 
 
 		 666 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  30.94 
 
 		 664 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  29.71 
 
 		 522 aa  243  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  35.88 
 
 		 630 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 		 545 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 		 545 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  34.6 
 
 		 536 aa  238  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  35.55 
 
 		 514 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  32.08 
 
 		 559 aa  232  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  32.86 
 
 		 647 aa  231  4e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 614 aa  225  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  29.74 
 
 		 519 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  29.74 
 
 		 642 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  29.74 
 
 		 642 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  33.27 
 
 		 491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  35.09 
 
 		 576 aa  206  9e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 511 aa  113  9e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.69 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 491 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 491 aa  100  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  23.19 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  23.19 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  23.19 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.43 
 
 		 486 aa  97.8  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.43 
 
 		 486 aa  97.8  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 522 aa  96.7  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  23.39 
 
 		 471 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  23.34 
 
 		 471 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  23.48 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  23.33 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>