More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1455 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  65.07 
 
 		 647 aa  761    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 635 aa  1236    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  46.83 
 
 		 614 aa  563  1.0000000000000001e-159  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  47.1 
 
 		 616 aa  514  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  41.23 
 
 		 630 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  38.42 
 
 		 546 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  35.99 
 
 		 576 aa  326  8.000000000000001e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  38.15 
 
 		 541 aa  310  5e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  38.89 
 
 		 537 aa  294  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  37.58 
 
 		 528 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  37.68 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  37.21 
 
 		 539 aa  291  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  37.21 
 
 		 539 aa  291  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  38 
 
 		 518 aa  289  8e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  32.48 
 
 		 532 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  36.73 
 
 		 555 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  38.26 
 
 		 530 aa  288  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  37.17 
 
 		 528 aa  287  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  36.92 
 
 		 546 aa  287  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  36.29 
 
 		 576 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  36.98 
 
 		 544 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  37.55 
 
 		 543 aa  283  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  32.96 
 
 		 532 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  32.52 
 
 		 532 aa  279  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  33.23 
 
 		 529 aa  279  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  38.58 
 
 		 539 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  38.58 
 
 		 539 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  37.84 
 
 		 533 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  37.84 
 
 		 533 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  37.84 
 
 		 533 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  32.32 
 
 		 543 aa  277  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  39 
 
 		 533 aa  277  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  37.84 
 
 		 533 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  37.84 
 
 		 533 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  37.84 
 
 		 533 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  37.84 
 
 		 533 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  32.22 
 
 		 530 aa  276  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  37.28 
 
 		 528 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  37.28 
 
 		 528 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  37.78 
 
 		 517 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  32.48 
 
 		 532 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  32.48 
 
 		 532 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  32.48 
 
 		 532 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  37.53 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  33.95 
 
 		 533 aa  257  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  35.71 
 
 		 541 aa  257  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  33.26 
 
 		 521 aa  254  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  31.02 
 
 		 541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  34.58 
 
 		 666 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  35.36 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  34.39 
 
 		 664 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  30.91 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  30.74 
 
 		 541 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  30.91 
 
 		 541 aa  250  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  30.74 
 
 		 541 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  30.74 
 
 		 541 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  33.48 
 
 		 543 aa  249  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  30.74 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  33.61 
 
 		 531 aa  246  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  33.47 
 
 		 522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  32.94 
 
 		 642 aa  242  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  32.94 
 
 		 642 aa  242  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  33.89 
 
 		 519 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  33.4 
 
 		 537 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 537 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  33.2 
 
 		 528 aa  234  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  32.49 
 
 		 535 aa  234  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  33.26 
 
 		 535 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  31.47 
 
 		 542 aa  229  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  31.47 
 
 		 542 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  33.4 
 
 		 560 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 536 aa  228  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  33.2 
 
 		 560 aa  226  7e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  33.12 
 
 		 516 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  31.96 
 
 		 533 aa  221  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  33.48 
 
 		 530 aa  221  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  33.33 
 
 		 518 aa  219  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  34.25 
 
 		 521 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  31.74 
 
 		 559 aa  209  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  30.92 
 
 		 545 aa  205  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  30.92 
 
 		 545 aa  205  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  31.66 
 
 		 514 aa  200  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  32.44 
 
 		 491 aa  199  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  30.72 
 
 		 511 aa  161  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  31.17 
 
 		 467 aa  143  9e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  29 
 
 		 503 aa  139  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  28.71 
 
 		 486 aa  127  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 539 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 471 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.68 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26 
 
 		 483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 471 aa  122  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.05 
 
 		 471 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.84 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.84 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.84 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.84 
 
 		 471 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 496 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.84 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>