More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1493 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  100 
 
 		 560 aa  1127    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  99.82 
 
 		 560 aa  1126    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  42.51 
 
 		 542 aa  470  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  44.2 
 
 		 542 aa  466  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  41.82 
 
 		 525 aa  405  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  40.77 
 
 		 518 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  39.77 
 
 		 531 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  40.21 
 
 		 535 aa  360  5e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  39.79 
 
 		 535 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  34.62 
 
 		 544 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  34.62 
 
 		 576 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  33.52 
 
 		 543 aa  329  7e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  38.39 
 
 		 533 aa  329  8e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  37.5 
 
 		 546 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  34.3 
 
 		 530 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  33.58 
 
 		 555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  37.71 
 
 		 537 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  34.15 
 
 		 533 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  34.15 
 
 		 533 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  34.15 
 
 		 533 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  34.15 
 
 		 533 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  34.15 
 
 		 533 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  34.15 
 
 		 533 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  34.15 
 
 		 533 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  34.39 
 
 		 533 aa  316  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  34.03 
 
 		 517 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  32.91 
 
 		 543 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  32.33 
 
 		 532 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  33.46 
 
 		 532 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  33.65 
 
 		 532 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  32.51 
 
 		 528 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  32.71 
 
 		 530 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  32.33 
 
 		 528 aa  309  9e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  34.86 
 
 		 521 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  33.21 
 
 		 546 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  32.33 
 
 		 532 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  33.27 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  33.46 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  33.46 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  33.27 
 
 		 541 aa  298  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  32.95 
 
 		 539 aa  296  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  32.96 
 
 		 533 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  32.95 
 
 		 539 aa  296  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  32.71 
 
 		 539 aa  293  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  32.71 
 
 		 539 aa  293  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  34.71 
 
 		 530 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  32.77 
 
 		 528 aa  286  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  32.77 
 
 		 528 aa  286  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  31.95 
 
 		 529 aa  284  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  32.44 
 
 		 536 aa  283  6.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  33 
 
 		 516 aa  280  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  32.87 
 
 		 518 aa  273  7e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 		 545 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 		 545 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  31.84 
 
 		 559 aa  263  6.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  31.89 
 
 		 543 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  32.77 
 
 		 537 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  32.77 
 
 		 537 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  32.58 
 
 		 537 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  34.6 
 
 		 616 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  32.29 
 
 		 541 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  32.89 
 
 		 522 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  32.59 
 
 		 541 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  31.7 
 
 		 666 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  32.19 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  32.19 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  32.58 
 
 		 541 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  32.58 
 
 		 541 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  29.52 
 
 		 491 aa  247  4e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  33.2 
 
 		 521 aa  247  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  32.58 
 
 		 541 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  32.19 
 
 		 664 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  31.78 
 
 		 541 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  32.19 
 
 		 541 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  32.48 
 
 		 514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 635 aa  244  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  34.62 
 
 		 630 aa  236  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  32.21 
 
 		 528 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  33.13 
 
 		 647 aa  233  8.000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  30.89 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  30.26 
 
 		 642 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  30.26 
 
 		 642 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  31.34 
 
 		 614 aa  223  6e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 		 576 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 467 aa  137  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 511 aa  125  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 522 aa  117  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 466 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.76 
 
 		 468 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 466 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 466 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.28 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.28 
 
 		 467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.28 
 
 		 467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.11 
 
 		 467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>