More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0439 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 528 aa  1019    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  100 
 
 		 528 aa  1019    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  50.19 
 
 		 539 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  50.19 
 
 		 539 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  51.54 
 
 		 539 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  51.54 
 
 		 539 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  44.38 
 
 		 533 aa  458  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  43.24 
 
 		 537 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  39.39 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  39.22 
 
 		 518 aa  334  2e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  37.71 
 
 		 546 aa  333  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  36.93 
 
 		 541 aa  319  9e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  37.6 
 
 		 546 aa  316  6e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  34.42 
 
 		 542 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  34.23 
 
 		 542 aa  292  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  34.69 
 
 		 544 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  35.56 
 
 		 535 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  34.51 
 
 		 576 aa  287  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  36.18 
 
 		 535 aa  286  7e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  35.74 
 
 		 543 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  34.33 
 
 		 543 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  34.36 
 
 		 521 aa  282  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  34.85 
 
 		 533 aa  282  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  32.77 
 
 		 560 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  34.54 
 
 		 529 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  34.99 
 
 		 522 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  32.58 
 
 		 560 aa  281  3e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  34.87 
 
 		 530 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  34.66 
 
 		 533 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  34.66 
 
 		 533 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  34.66 
 
 		 533 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  34.16 
 
 		 532 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  33.46 
 
 		 530 aa  279  7e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  35.1 
 
 		 532 aa  279  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  34.38 
 
 		 531 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  31.88 
 
 		 528 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  34.59 
 
 		 533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  34.59 
 
 		 533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  34.59 
 
 		 533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  34.59 
 
 		 533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  33.52 
 
 		 555 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  31.69 
 
 		 528 aa  272  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  33.97 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  37.28 
 
 		 635 aa  271  2.9999999999999997e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  34.73 
 
 		 532 aa  270  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  34.33 
 
 		 517 aa  269  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  32.11 
 
 		 541 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  35.45 
 
 		 518 aa  266  5e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  32.11 
 
 		 664 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  32.11 
 
 		 666 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  36.77 
 
 		 514 aa  263  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  34.54 
 
 		 532 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  31.59 
 
 		 541 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  34.54 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  34.54 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  33.92 
 
 		 516 aa  261  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  32.82 
 
 		 533 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  32.84 
 
 		 541 aa  257  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  32.36 
 
 		 537 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  32.68 
 
 		 537 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  32.16 
 
 		 537 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  32.77 
 
 		 541 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  32.63 
 
 		 541 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  34.46 
 
 		 630 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  32.77 
 
 		 541 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  30.92 
 
 		 543 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  32.42 
 
 		 541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  32.42 
 
 		 541 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  32.42 
 
 		 541 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  35.51 
 
 		 647 aa  248  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  30.75 
 
 		 519 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  33.99 
 
 		 614 aa  247  3e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  32.88 
 
 		 521 aa  248  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  30.75 
 
 		 642 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  30.75 
 
 		 642 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  33.83 
 
 		 530 aa  243  6e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  31.3 
 
 		 545 aa  239  6.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  31.3 
 
 		 545 aa  239  6.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  31.67 
 
 		 528 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  31.41 
 
 		 559 aa  234  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  32.88 
 
 		 536 aa  234  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  35.33 
 
 		 616 aa  233  6e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  29.89 
 
 		 491 aa  202  9e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  32.39 
 
 		 576 aa  180  5.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  24.91 
 
 		 511 aa  117  7.999999999999999e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 539 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 503 aa  101  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 494 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 506 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 496 aa  91.3  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  23.5 
 
 		 462 aa  90.1  9e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  24.83 
 
 		 483 aa  89.4  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.76 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.76 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 486 aa  83.6  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>