More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A0684 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  100 
 
 
560 aa  1128    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  99.82 
 
 
560 aa  1126    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  44.2 
 
 
542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  44.01 
 
 
542 aa  465  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  41.62 
 
 
525 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  40.58 
 
 
518 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  39.59 
 
 
531 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  40 
 
 
535 aa  359  8e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  39.58 
 
 
535 aa  358  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  34.43 
 
 
544 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  34.43 
 
 
576 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  38.39 
 
 
533 aa  330  5.0000000000000004e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  34.48 
 
 
530 aa  329  7e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  33.33 
 
 
543 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  37.29 
 
 
546 aa  327  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  33.77 
 
 
555 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  37.5 
 
 
537 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  34.33 
 
 
533 aa  320  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  34.33 
 
 
533 aa  320  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  34.33 
 
 
533 aa  320  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  34.33 
 
 
533 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  34.33 
 
 
533 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  34.33 
 
 
533 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  34.33 
 
 
533 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  34.58 
 
 
533 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  34.23 
 
 
517 aa  316  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  33.09 
 
 
543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  32.52 
 
 
532 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  33.65 
 
 
532 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  33.83 
 
 
532 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  32.7 
 
 
528 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  32.89 
 
 
530 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  32.51 
 
 
528 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  34.67 
 
 
521 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  32.52 
 
 
532 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  33.03 
 
 
546 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  33.65 
 
 
532 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  33.65 
 
 
532 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  33.46 
 
 
532 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  33.08 
 
 
541 aa  297  3e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  32.96 
 
 
533 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  32.77 
 
 
539 aa  296  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  32.77 
 
 
539 aa  296  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  34.71 
 
 
530 aa  292  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  32.52 
 
 
539 aa  292  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  32.52 
 
 
539 aa  292  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  32.58 
 
 
528 aa  286  9e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  32.58 
 
 
528 aa  286  9e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  31.77 
 
 
529 aa  283  6.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  32.44 
 
 
536 aa  283  6.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  33.2 
 
 
516 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  32.68 
 
 
518 aa  272  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 
545 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 
545 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  31.84 
 
 
559 aa  263  6.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  31.89 
 
 
543 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  32.77 
 
 
537 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  32.77 
 
 
537 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  32.58 
 
 
537 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  34.81 
 
 
616 aa  256  6e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  32.29 
 
 
541 aa  253  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  32.89 
 
 
522 aa  253  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  32.59 
 
 
541 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  32.19 
 
 
541 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  32.19 
 
 
541 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  31.7 
 
 
666 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  33.2 
 
 
521 aa  248  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  32.58 
 
 
541 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  29.52 
 
 
491 aa  247  4e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  32.58 
 
 
541 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  32.19 
 
 
541 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  31.78 
 
 
541 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  32.58 
 
 
541 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  32.19 
 
 
664 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  32.27 
 
 
514 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  33.13 
 
 
635 aa  243  6e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  34.41 
 
 
630 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  32.21 
 
 
528 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  33.13 
 
 
647 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  30.89 
 
 
642 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  30.89 
 
 
642 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  30.89 
 
 
519 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  31.13 
 
 
614 aa  222  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 
576 aa  198  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  28.68 
 
 
467 aa  137  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 
511 aa  124  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 
522 aa  118  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 
466 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.76 
 
 
468 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 
466 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.28 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  23.23 
 
 
491 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.28 
 
 
467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.05 
 
 
467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>