More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1691 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  62.43 
 
 		 537 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 522 aa  1035    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  60.89 
 
 		 541 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  60.89 
 
 		 664 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  60.73 
 
 		 543 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  61.66 
 
 		 541 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  61.85 
 
 		 541 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  62.04 
 
 		 541 aa  670    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  64.37 
 
 		 537 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  61.85 
 
 		 541 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  64.98 
 
 		 521 aa  674    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  62.62 
 
 		 537 aa  674    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  61.27 
 
 		 541 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  61.46 
 
 		 541 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  61.7 
 
 		 541 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  61.85 
 
 		 541 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  61.08 
 
 		 666 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  58.38 
 
 		 519 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  58.38 
 
 		 642 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  58.38 
 
 		 642 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  58.54 
 
 		 528 aa  598  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  51.08 
 
 		 529 aa  553  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  37.88 
 
 		 541 aa  360  5e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  39.09 
 
 		 544 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  39.09 
 
 		 576 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  38.9 
 
 		 530 aa  349  7e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  36.42 
 
 		 528 aa  346  7e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  38.2 
 
 		 546 aa  345  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  36.6 
 
 		 528 aa  345  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  37.33 
 
 		 555 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  37.26 
 
 		 543 aa  341  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  38.58 
 
 		 517 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  38.37 
 
 		 533 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  38.59 
 
 		 530 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  38.72 
 
 		 533 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  38.72 
 
 		 533 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  38.72 
 
 		 533 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  38.53 
 
 		 533 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  38.53 
 
 		 533 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  38.33 
 
 		 532 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  38.53 
 
 		 533 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  38.53 
 
 		 533 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  38.77 
 
 		 543 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  38.33 
 
 		 532 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  39.09 
 
 		 532 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  38.33 
 
 		 532 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  38.71 
 
 		 532 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  38.71 
 
 		 532 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  38.71 
 
 		 532 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  36.33 
 
 		 525 aa  311  2e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  36.69 
 
 		 518 aa  310  5e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  34.72 
 
 		 530 aa  293  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  36.52 
 
 		 546 aa  293  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  34.99 
 
 		 528 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  34.99 
 
 		 528 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  36.54 
 
 		 533 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  34.73 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  33.92 
 
 		 545 aa  287  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  33.92 
 
 		 545 aa  287  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  33.52 
 
 		 536 aa  286  9e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  34.42 
 
 		 537 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  34.13 
 
 		 559 aa  280  6e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  32.2 
 
 		 521 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  31.56 
 
 		 616 aa  250  5e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  32.23 
 
 		 542 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  31.61 
 
 		 491 aa  249  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  32.89 
 
 		 531 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  33.08 
 
 		 560 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  32.3 
 
 		 542 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  33.08 
 
 		 560 aa  247  4e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  31.66 
 
 		 539 aa  247  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  31.66 
 
 		 539 aa  247  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  35.67 
 
 		 630 aa  246  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  29.3 
 
 		 533 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  32.5 
 
 		 539 aa  244  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  32.5 
 
 		 539 aa  244  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  34.45 
 
 		 635 aa  243  7.999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  31.6 
 
 		 535 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  32.32 
 
 		 535 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 		 614 aa  227  5.0000000000000005e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  31.16 
 
 		 518 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  30.96 
 
 		 514 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 		 576 aa  205  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  32.52 
 
 		 647 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 		 511 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 539 aa  150  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  30.52 
 
 		 471 aa  150  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  30.08 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  30.08 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  30.08 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  30.08 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  30.08 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  30.1 
 
 		 471 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  29.46 
 
 		 471 aa  146  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  29.48 
 
 		 471 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 522 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.26 
 
 		 471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  30.05 
 
 		 471 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  29.38 
 
 		 471 aa  140  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>