More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0806 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 530 aa  1036    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  58.52 
 
 		 544 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  58.33 
 
 		 576 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  58.04 
 
 		 543 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  57.14 
 
 		 533 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  57.06 
 
 		 532 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  56.93 
 
 		 555 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  56.77 
 
 		 533 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  56.77 
 
 		 533 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  56.77 
 
 		 533 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  56.39 
 
 		 533 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  58.38 
 
 		 532 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  56.39 
 
 		 533 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  56.39 
 
 		 533 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  56.39 
 
 		 533 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  56.87 
 
 		 530 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  57.25 
 
 		 517 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  57.41 
 
 		 543 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  57.06 
 
 		 532 aa  581  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  56.5 
 
 		 532 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  56.87 
 
 		 532 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  58.25 
 
 		 516 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  56.87 
 
 		 532 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  56.87 
 
 		 532 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  52.69 
 
 		 530 aa  535  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  48 
 
 		 528 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  48.08 
 
 		 528 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  40.24 
 
 		 559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  40.2 
 
 		 545 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  40.2 
 
 		 545 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  40.54 
 
 		 536 aa  393  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  39.24 
 
 		 491 aa  376  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 		 529 aa  343  5e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  38.33 
 
 		 541 aa  319  7e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  39.73 
 
 		 546 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  36.98 
 
 		 525 aa  306  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  36.61 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  35.61 
 
 		 541 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  36.36 
 
 		 528 aa  302  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  35.29 
 
 		 541 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  35.29 
 
 		 664 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  35.61 
 
 		 543 aa  296  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  35.29 
 
 		 666 aa  296  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  34.72 
 
 		 522 aa  293  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  35.86 
 
 		 537 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  36.14 
 
 		 537 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  36.09 
 
 		 537 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  35.29 
 
 		 541 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  35.28 
 
 		 541 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  35.28 
 
 		 541 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  35.28 
 
 		 541 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  35.1 
 
 		 541 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  34.78 
 
 		 541 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  34.91 
 
 		 541 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  35.52 
 
 		 521 aa  279  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  34.71 
 
 		 560 aa  279  8e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  34.71 
 
 		 560 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  34.42 
 
 		 519 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  34.42 
 
 		 642 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  34.42 
 
 		 642 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  35.91 
 
 		 542 aa  273  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  34.09 
 
 		 531 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  35.71 
 
 		 542 aa  269  8e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  35.78 
 
 		 546 aa  266  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  36.13 
 
 		 533 aa  256  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  33.02 
 
 		 537 aa  246  6e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  34.9 
 
 		 533 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  33.83 
 
 		 528 aa  240  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  33.83 
 
 		 528 aa  240  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  32.26 
 
 		 521 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  33.14 
 
 		 539 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  33.14 
 
 		 539 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  34.25 
 
 		 539 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  34.25 
 
 		 539 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  32.03 
 
 		 535 aa  233  9e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  36.55 
 
 		 630 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  30.32 
 
 		 535 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  33.48 
 
 		 635 aa  219  7e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  31.32 
 
 		 616 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  32.12 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  30.68 
 
 		 647 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  31.35 
 
 		 576 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  32.7 
 
 		 518 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  31.55 
 
 		 614 aa  187  3e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  28.2 
 
 		 511 aa  161  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 522 aa  152  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 503 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 476 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  29.71 
 
 		 486 aa  121  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.44 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.45 
 
 		 467 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  26.57 
 
 		 525 aa  117  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  29.77 
 
 		 467 aa  116  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.24 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.24 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.39 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  27.97 
 
 		 483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>