More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0129 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 614 aa  1194    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  46.83 
 
 		 635 aa  559  1e-158  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  44.34 
 
 		 647 aa  497  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  38.65 
 
 		 616 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  40.48 
 
 		 630 aa  372  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  37.45 
 
 		 539 aa  279  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  37.45 
 
 		 539 aa  279  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  34.73 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  36.8 
 
 		 541 aa  267  5e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  31.95 
 
 		 530 aa  265  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  31.34 
 
 		 529 aa  264  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  37.19 
 
 		 539 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  37.19 
 
 		 539 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  30.92 
 
 		 546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  36.61 
 
 		 546 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  33.19 
 
 		 528 aa  246  9e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  33.19 
 
 		 528 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  33.99 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  33.99 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  35.02 
 
 		 576 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  31.5 
 
 		 521 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  35.02 
 
 		 544 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  34.18 
 
 		 525 aa  240  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 522 aa  239  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  34.5 
 
 		 537 aa  239  9e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  30.23 
 
 		 532 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  31.18 
 
 		 533 aa  237  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  34.12 
 
 		 518 aa  236  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  29.9 
 
 		 532 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 555 aa  236  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  34.82 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  34.82 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  34.82 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  32.4 
 
 		 543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  29.07 
 
 		 543 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  33.33 
 
 		 533 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  34.61 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  34.61 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  34.61 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  34.61 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  32.74 
 
 		 543 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  29.04 
 
 		 530 aa  232  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  30.23 
 
 		 532 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  34.05 
 
 		 532 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  32.12 
 
 		 531 aa  227  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  33.63 
 
 		 517 aa  227  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  34.68 
 
 		 541 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  33.86 
 
 		 537 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  32.15 
 
 		 542 aa  221  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  35.63 
 
 		 533 aa  220  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  32.07 
 
 		 542 aa  220  7e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  33.83 
 
 		 518 aa  219  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  33.41 
 
 		 537 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  34.08 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  33.41 
 
 		 537 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  33.76 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  33.76 
 
 		 532 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  33.76 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  34.08 
 
 		 541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  34.3 
 
 		 541 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  34.3 
 
 		 541 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  33.85 
 
 		 541 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  33.85 
 
 		 664 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  34.23 
 
 		 541 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  33.85 
 
 		 666 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  33.85 
 
 		 541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  31.34 
 
 		 560 aa  214  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  34.3 
 
 		 541 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  31.13 
 
 		 560 aa  213  9e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  31.95 
 
 		 521 aa  211  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  32.59 
 
 		 519 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  32.59 
 
 		 642 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  32.59 
 
 		 642 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  34.59 
 
 		 528 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  30.74 
 
 		 516 aa  200  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  29 
 
 		 536 aa  199  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  30.62 
 
 		 514 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  29.67 
 
 		 535 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  28.84 
 
 		 535 aa  190  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  31.55 
 
 		 530 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 545 aa  186  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 545 aa  186  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  30.8 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  28.15 
 
 		 559 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  30.49 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  30.9 
 
 		 467 aa  133  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  28.86 
 
 		 483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 		 491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 496 aa  118  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  27.86 
 
 		 486 aa  112  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  27.86 
 
 		 486 aa  112  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.39 
 
 		 494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 		 522 aa  111  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.46 
 
 		 463 aa  110  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 464 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.51 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 		 466 aa  109  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 481 aa  106  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>