More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0361 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 539 aa  1054    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  52.73 
 
 		 511 aa  513  1e-144  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  47.24 
 
 		 522 aa  482  1e-135  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 530 aa  186  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  27.56 
 
 		 555 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 		 541 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 529 aa  171  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  27.57 
 
 		 517 aa  170  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 		 543 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  30.98 
 
 		 616 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 		 530 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  28.54 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  28.54 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  28.54 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  28.54 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  28.36 
 
 		 533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  28.36 
 
 		 533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  28.36 
 
 		 533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  27.77 
 
 		 532 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  28.36 
 
 		 533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 537 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 		 537 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  26.82 
 
 		 537 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  27.08 
 
 		 541 aa  160  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  28.2 
 
 		 521 aa  159  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 532 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 522 aa  158  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  29.52 
 
 		 533 aa  158  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 		 532 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  27.29 
 
 		 532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  27.24 
 
 		 543 aa  154  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  26.28 
 
 		 664 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  26.28 
 
 		 541 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  26.28 
 
 		 666 aa  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  25.94 
 
 		 528 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  25.94 
 
 		 528 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 576 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 544 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 545 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 545 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  25.68 
 
 		 559 aa  147  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 546 aa  146  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 576 aa  143  8e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  25.49 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  25.49 
 
 		 642 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  25.49 
 
 		 642 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  27.54 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  26.76 
 
 		 525 aa  140  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  29.36 
 
 		 537 aa  140  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 541 aa  140  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 541 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 		 541 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  26.29 
 
 		 518 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 541 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  26.74 
 
 		 528 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 541 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  28.76 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 		 630 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 614 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  25.2 
 
 		 542 aa  130  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  25.2 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 		 546 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 635 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 647 aa  124  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  24.95 
 
 		 514 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  23.99 
 
 		 491 aa  116  8.999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  24.25 
 
 		 518 aa  114  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  24.95 
 
 		 539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  24.85 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  24.29 
 
 		 535 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 530 aa  107  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  25.92 
 
 		 467 aa  107  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  23.14 
 
 		 516 aa  107  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  23.98 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  24.47 
 
 		 521 aa  103  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  25.05 
 
 		 539 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 539 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 		 503 aa  98.2  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  23.79 
 
 		 560 aa  97.1  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  23.59 
 
 		 560 aa  96.3  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  25 
 
 		 533 aa  94.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  25.11 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  28.92 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 468 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  25.6 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 455 aa  67  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 491 aa  67  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  26.54 
 
 		 458 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  26.23 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>