More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1725 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  100 
 
 
525 aa  1040    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  99.61 
 
 
518 aa  1018    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  43.41 
 
 
531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  41.82 
 
 
560 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  40.95 
 
 
537 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  41.62 
 
 
560 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  41.39 
 
 
533 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  40.38 
 
 
539 aa  360  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  40.38 
 
 
539 aa  360  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  39.25 
 
 
542 aa  353  5.9999999999999994e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  39.05 
 
 
542 aa  348  9e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  37.77 
 
 
555 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  38.26 
 
 
521 aa  343  5e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  39.85 
 
 
533 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  37.81 
 
 
546 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  38.21 
 
 
517 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  37.9 
 
 
533 aa  330  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  37.6 
 
 
543 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  37.6 
 
 
530 aa  329  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  38.48 
 
 
539 aa  329  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  38.48 
 
 
539 aa  329  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  36.8 
 
 
533 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  36.8 
 
 
533 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  36.8 
 
 
533 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  35.91 
 
 
532 aa  329  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  36.8 
 
 
533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  36.8 
 
 
533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  36.8 
 
 
533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  36.8 
 
 
533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  36.26 
 
 
528 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  36.58 
 
 
543 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  35.91 
 
 
532 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  38.08 
 
 
530 aa  323  6e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  36.87 
 
 
532 aa  323  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  37.18 
 
 
532 aa  322  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  35.88 
 
 
528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  39.39 
 
 
528 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  39.39 
 
 
528 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  36.69 
 
 
535 aa  318  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  36.9 
 
 
544 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  36.31 
 
 
576 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  36.22 
 
 
535 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  36.78 
 
 
529 aa  313  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  36.85 
 
 
518 aa  312  7.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  35.91 
 
 
532 aa  309  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  35.91 
 
 
532 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  35.91 
 
 
532 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  37.8 
 
 
546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  36.33 
 
 
522 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  35.83 
 
 
516 aa  297  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  35.49 
 
 
541 aa  294  2e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  36.98 
 
 
530 aa  294  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  35.6 
 
 
543 aa  289  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  34.3 
 
 
541 aa  289  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  35.6 
 
 
537 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  35.27 
 
 
541 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  35.27 
 
 
541 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  34.88 
 
 
541 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  35.8 
 
 
537 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  35.8 
 
 
537 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  37.68 
 
 
635 aa  283  4.0000000000000003e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  35.86 
 
 
536 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  35.08 
 
 
541 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  35.08 
 
 
541 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  33.91 
 
 
541 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  33.91 
 
 
664 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  33.91 
 
 
666 aa  280  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  34.3 
 
 
541 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  34.5 
 
 
541 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  38.23 
 
 
514 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  34.07 
 
 
559 aa  271  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  32.88 
 
 
545 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  32.88 
 
 
545 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  34.44 
 
 
521 aa  269  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  36.85 
 
 
616 aa  266  5e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  32.64 
 
 
491 aa  262  8.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  32.56 
 
 
519 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  32.56 
 
 
642 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  32.56 
 
 
642 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  34.06 
 
 
528 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  35.29 
 
 
630 aa  243  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  34.85 
 
 
647 aa  238  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  34.18 
 
 
614 aa  229  8e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  32.94 
 
 
576 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  29.25 
 
 
503 aa  160  7e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 
467 aa  144  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 
511 aa  143  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 
522 aa  131  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 
539 aa  130  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 
491 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.41 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.57 
 
 
483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  28.39 
 
 
463 aa  120  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  27.94 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  28.39 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 
496 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  27.94 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  26.82 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  28.15 
 
 
467 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  28.15 
 
 
467 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>