More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2704 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  100 
 
 
616 aa  1195    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  47.09 
 
 
635 aa  505  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  44.06 
 
 
647 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  38.7 
 
 
630 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  38.65 
 
 
614 aa  404  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  39.44 
 
 
530 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  33.71 
 
 
546 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  35.68 
 
 
576 aa  303  6.000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  39.37 
 
 
529 aa  297  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  35.96 
 
 
541 aa  289  1e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  36.9 
 
 
528 aa  286  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  36.69 
 
 
528 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  35.79 
 
 
555 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  36.85 
 
 
525 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  35.66 
 
 
576 aa  270  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  37.25 
 
 
518 aa  270  8e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  37.07 
 
 
533 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  37.07 
 
 
533 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  37.07 
 
 
533 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  36.38 
 
 
544 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  37.28 
 
 
533 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  37.07 
 
 
533 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  37.07 
 
 
533 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  37.07 
 
 
533 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  37.07 
 
 
533 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  30.92 
 
 
543 aa  267  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  36.54 
 
 
543 aa  267  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  36.02 
 
 
517 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  29.56 
 
 
541 aa  259  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  35.34 
 
 
543 aa  258  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  35.57 
 
 
530 aa  257  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  35.36 
 
 
532 aa  257  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  30.15 
 
 
537 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  30.15 
 
 
537 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  38.17 
 
 
537 aa  256  9e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  29.98 
 
 
537 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  29.72 
 
 
541 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  29.72 
 
 
664 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  34.17 
 
 
533 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  29.62 
 
 
666 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  29.16 
 
 
519 aa  250  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  31.56 
 
 
522 aa  250  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  29.16 
 
 
642 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  35.71 
 
 
532 aa  250  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  29.16 
 
 
642 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  33.11 
 
 
521 aa  249  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  29.9 
 
 
541 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  29.67 
 
 
541 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  35.87 
 
 
532 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 
541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  34.81 
 
 
560 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 
541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  29.51 
 
 
541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  35.14 
 
 
532 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  30.81 
 
 
560 aa  244  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 
541 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  29.56 
 
 
541 aa  243  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  30.1 
 
 
528 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  34.53 
 
 
546 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  35.48 
 
 
532 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  35.84 
 
 
539 aa  232  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  35.48 
 
 
532 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  35.48 
 
 
532 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  35.84 
 
 
539 aa  232  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  28.6 
 
 
516 aa  231  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  33.19 
 
 
531 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  33.98 
 
 
539 aa  231  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  33.98 
 
 
539 aa  231  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  35.33 
 
 
528 aa  229  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  35.33 
 
 
528 aa  229  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 
536 aa  222  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  34.74 
 
 
533 aa  221  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  31.02 
 
 
521 aa  217  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  30.6 
 
 
535 aa  213  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  31.32 
 
 
530 aa  211  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  31.09 
 
 
535 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  27.97 
 
 
491 aa  201  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  32.82 
 
 
511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  30.67 
 
 
545 aa  197  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  30.67 
 
 
545 aa  197  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  28.63 
 
 
542 aa  196  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  28.48 
 
 
542 aa  195  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  29.59 
 
 
518 aa  193  8e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  29.74 
 
 
559 aa  192  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  30.59 
 
 
514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  30.67 
 
 
539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  30.61 
 
 
467 aa  132  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 
503 aa  120  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 
486 aa  120  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  27.37 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  28.42 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  23.18 
 
 
494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 
496 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 
471 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 
468 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25 
 
 
471 aa  107  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25 
 
 
471 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25 
 
 
471 aa  107  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25 
 
 
471 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>