More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2457 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  75.47 
 
 
539 aa  791    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  75.47 
 
 
539 aa  791    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  100 
 
 
539 aa  1055    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  100 
 
 
539 aa  1055    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  51.54 
 
 
528 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  51.54 
 
 
528 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  49.37 
 
 
533 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  47.1 
 
 
537 aa  425  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  40.38 
 
 
525 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  40.5 
 
 
518 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  39.05 
 
 
546 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  42.99 
 
 
541 aa  317  5e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  38.65 
 
 
546 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  34.7 
 
 
529 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  35.15 
 
 
544 aa  289  8e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  32.95 
 
 
560 aa  289  9e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  35.15 
 
 
576 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  32.77 
 
 
560 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  37.79 
 
 
533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  37.47 
 
 
535 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  34.03 
 
 
542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  36.4 
 
 
535 aa  283  7.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  34.81 
 
 
531 aa  282  1e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  32.82 
 
 
528 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  33.84 
 
 
542 aa  280  6e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  32.82 
 
 
528 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  36.26 
 
 
518 aa  277  4e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  35.23 
 
 
533 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  35.23 
 
 
533 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  35.23 
 
 
533 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  36.26 
 
 
530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  33.4 
 
 
543 aa  274  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  32.89 
 
 
555 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  38.58 
 
 
635 aa  274  4.0000000000000004e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  34.16 
 
 
532 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  34.55 
 
 
517 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  35.04 
 
 
533 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  35.04 
 
 
533 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  35.04 
 
 
533 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  35.04 
 
 
533 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  34.22 
 
 
533 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  33.59 
 
 
530 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 
543 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  33.59 
 
 
532 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 
543 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  34.39 
 
 
521 aa  267  4e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  37.42 
 
 
614 aa  265  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  37.26 
 
 
514 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  35.31 
 
 
516 aa  264  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  33.79 
 
 
537 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  34.09 
 
 
532 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  33.6 
 
 
537 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  33.6 
 
 
537 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  34.28 
 
 
532 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  32.06 
 
 
541 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  33.9 
 
 
532 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  31.21 
 
 
541 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  33.9 
 
 
532 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  33.9 
 
 
532 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  30.96 
 
 
541 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  31.02 
 
 
664 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  35.92 
 
 
630 aa  249  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  31.02 
 
 
666 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  31.68 
 
 
541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  31.68 
 
 
541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  31.47 
 
 
541 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  34.31 
 
 
521 aa  243  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  32.24 
 
 
541 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  31.49 
 
 
541 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  32.5 
 
 
522 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  31.49 
 
 
541 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  33.14 
 
 
530 aa  237  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0501787 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  35.4 
 
 
616 aa  236  7e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  29.87 
 
 
536 aa  236  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  35.22 
 
 
647 aa  232  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  33.73 
 
 
528 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  29.4 
 
 
545 aa  226  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  29.4 
 
 
545 aa  226  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  30.06 
 
 
642 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  30.06 
 
 
642 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  30 
 
 
519 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  29.58 
 
 
491 aa  217  5e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  28.91 
 
 
559 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  33.8 
 
 
576 aa  205  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 
511 aa  117  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 
495 aa  106  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 
495 aa  104  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  28.06 
 
 
471 aa  104  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 
486 aa  104  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 
539 aa  103  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  26.99 
 
 
462 aa  101  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 
503 aa  100  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  26.64 
 
 
495 aa  100  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 
494 aa  99.8  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 
522 aa  99  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.31 
 
 
471 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.31 
 
 
471 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.31 
 
 
471 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.31 
 
 
471 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>