More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3549 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  79.92 
 
 		 537 aa  823    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  68.15 
 
 		 528 aa  667    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  84.47 
 
 		 642 aa  899    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  87.99 
 
 		 541 aa  953    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  84.47 
 
 		 519 aa  900    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  95.74 
 
 		 541 aa  987    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  87.99 
 
 		 666 aa  952    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  87.99 
 
 		 664 aa  954    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  80.77 
 
 		 543 aa  848    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  95.56 
 
 		 541 aa  990    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  61.46 
 
 		 522 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  84.47 
 
 		 642 aa  899    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  88.91 
 
 		 541 aa  966    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  79.92 
 
 		 537 aa  825    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  94.82 
 
 		 541 aa  984    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  94.45 
 
 		 541 aa  981    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  99.26 
 
 		 541 aa  1061    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  72.2 
 
 		 521 aa  729    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  80.12 
 
 		 537 aa  826    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  94.82 
 
 		 541 aa  984    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 541 aa  1069    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  55.6 
 
 		 529 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  38.52 
 
 		 544 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  38.52 
 
 		 576 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  39.1 
 
 		 541 aa  360  4e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  37.38 
 
 		 543 aa  350  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  39.89 
 
 		 546 aa  345  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  38.35 
 
 		 530 aa  344  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  37.5 
 
 		 555 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  38.48 
 
 		 517 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  38.55 
 
 		 533 aa  342  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  38.55 
 
 		 533 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  38.55 
 
 		 533 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  38.55 
 
 		 533 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  38.24 
 
 		 532 aa  339  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  38.24 
 
 		 532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  37.98 
 
 		 543 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  37.36 
 
 		 530 aa  335  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  35.09 
 
 		 528 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  38.24 
 
 		 532 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  35.28 
 
 		 528 aa  333  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  38.17 
 
 		 533 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  38.17 
 
 		 533 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  38.17 
 
 		 533 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  38.17 
 
 		 533 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  38.81 
 
 		 532 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  38.62 
 
 		 532 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  38.62 
 
 		 532 aa  329  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  38.62 
 
 		 532 aa  329  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  36.01 
 
 		 516 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  34.5 
 
 		 525 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  34.91 
 
 		 530 aa  291  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  34.3 
 
 		 518 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  32.18 
 
 		 545 aa  280  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  32.18 
 
 		 545 aa  280  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  35.88 
 
 		 537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  32.05 
 
 		 536 aa  273  8.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  32.05 
 
 		 559 aa  270  7e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  33.46 
 
 		 539 aa  266  8e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  33.46 
 
 		 539 aa  266  8e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  35.34 
 
 		 546 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  29.51 
 
 		 616 aa  261  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  31.72 
 
 		 528 aa  259  9e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  31.72 
 
 		 528 aa  259  9e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  34.48 
 
 		 533 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  30.91 
 
 		 635 aa  255  2.0000000000000002e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  32.08 
 
 		 533 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  31.49 
 
 		 521 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  31.66 
 
 		 539 aa  244  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  31.66 
 
 		 539 aa  244  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  29.96 
 
 		 491 aa  243  6e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  31.6 
 
 		 630 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  33.14 
 
 		 531 aa  240  5e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  31.6 
 
 		 560 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  31.6 
 
 		 560 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  30.48 
 
 		 542 aa  235  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  30.23 
 
 		 542 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  30.14 
 
 		 535 aa  226  9e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  29.4 
 
 		 518 aa  221  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  29.94 
 
 		 535 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  34.08 
 
 		 614 aa  218  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  32.79 
 
 		 647 aa  206  7e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  29.91 
 
 		 576 aa  195  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  29.96 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  30.55 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  32.27 
 
 		 467 aa  147  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 539 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.99 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.99 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  29.86 
 
 		 471 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  29.86 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.99 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  29.86 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  29.86 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.99 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  29.86 
 
 		 471 aa  135  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  29.86 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  29.86 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.99 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  29.86 
 
 		 471 aa  134  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>