More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2241 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  100 
 
 		 518 aa  994    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  71.48 
 
 		 514 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  36.85 
 
 		 525 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  36.85 
 
 		 518 aa  317  4e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  34.67 
 
 		 531 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  36.26 
 
 		 539 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  36.26 
 
 		 539 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  35.93 
 
 		 539 aa  272  9e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  35.93 
 
 		 539 aa  272  9e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  35.95 
 
 		 533 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  36.59 
 
 		 533 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  35.45 
 
 		 528 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  35.45 
 
 		 528 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  35.05 
 
 		 542 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  33.54 
 
 		 521 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  32.87 
 
 		 560 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  32.68 
 
 		 560 aa  261  3e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  34.37 
 
 		 542 aa  259  6e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  36.38 
 
 		 546 aa  257  4e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  33.74 
 
 		 535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  34.3 
 
 		 535 aa  253  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  33.05 
 
 		 537 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  32.48 
 
 		 532 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  32.28 
 
 		 544 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  32.28 
 
 		 576 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  30.45 
 
 		 528 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  33.27 
 
 		 532 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  32.81 
 
 		 532 aa  239  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  32.48 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  34.43 
 
 		 541 aa  237  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  30.39 
 
 		 528 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  33.14 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  33.14 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  33.14 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  32.81 
 
 		 533 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  32.48 
 
 		 532 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  32.48 
 
 		 532 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  32.48 
 
 		 532 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  30.52 
 
 		 555 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  33.97 
 
 		 546 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  32.81 
 
 		 533 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  32.81 
 
 		 533 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  32.81 
 
 		 533 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  32.81 
 
 		 533 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  34.38 
 
 		 516 aa  230  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  31.2 
 
 		 517 aa  229  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  30.97 
 
 		 543 aa  228  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  31.82 
 
 		 530 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  31.54 
 
 		 543 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  31.54 
 
 		 530 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  31.4 
 
 		 529 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  29.2 
 
 		 541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  29.3 
 
 		 541 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  29.3 
 
 		 541 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  29.3 
 
 		 541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  29.3 
 
 		 541 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  28.89 
 
 		 541 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 		 543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  33.83 
 
 		 614 aa  213  5.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  31.16 
 
 		 522 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 541 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  29.74 
 
 		 537 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 		 537 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 537 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  28 
 
 		 541 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  28.87 
 
 		 545 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  28.87 
 
 		 545 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  28.2 
 
 		 666 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  33.74 
 
 		 630 aa  209  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  28 
 
 		 664 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 635 aa  208  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  27.33 
 
 		 559 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 536 aa  204  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 		 616 aa  192  9e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  27.4 
 
 		 519 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  32.7 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  27.4 
 
 		 642 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  27.4 
 
 		 642 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  31.67 
 
 		 528 aa  186  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 521 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  27.71 
 
 		 491 aa  180  5.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  30.16 
 
 		 647 aa  179  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  30.92 
 
 		 576 aa  147  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 467 aa  137  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  29.45 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 511 aa  118  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  23.83 
 
 		 522 aa  101  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  26.78 
 
 		 452 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 539 aa  99.4  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  26.7 
 
 		 489 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 440 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 440 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  26.78 
 
 		 485 aa  94  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  27.02 
 
 		 495 aa  94.4  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.98 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  24.71 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.26 
 
 		 467 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.26 
 
 		 467 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 444 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>