More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0435 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  87.14 
 
 		 543 aa  896    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  58.24 
 
 		 528 aa  642    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  72.74 
 
 		 543 aa  789    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  72.92 
 
 		 544 aa  776    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  57.85 
 
 		 528 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  90.98 
 
 		 533 aa  955    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  95.48 
 
 		 532 aa  979    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  90.98 
 
 		 533 aa  955    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  72.73 
 
 		 576 aa  776    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  96.42 
 
 		 532 aa  961    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  91.35 
 
 		 533 aa  962    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  91.35 
 
 		 533 aa  962    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  94.54 
 
 		 532 aa  967    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  90.98 
 
 		 533 aa  955    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  92.29 
 
 		 533 aa  967    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  63.41 
 
 		 516 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  88.2 
 
 		 517 aa  926    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  62.86 
 
 		 530 aa  662    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 532 aa  1058    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  88.7 
 
 		 555 aa  956    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  96.23 
 
 		 532 aa  961    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  91.35 
 
 		 533 aa  962    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  99.44 
 
 		 532 aa  1055    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  87.76 
 
 		 530 aa  920    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  90.98 
 
 		 533 aa  955    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  96.23 
 
 		 532 aa  961    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  57.06 
 
 		 530 aa  597  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  45.21 
 
 		 545 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  45.21 
 
 		 545 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  44.19 
 
 		 559 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  45.21 
 
 		 536 aa  458  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  42.49 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  40.04 
 
 		 529 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  39.62 
 
 		 541 aa  375  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  40.38 
 
 		 546 aa  365  1e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  38.79 
 
 		 528 aa  347  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  36.17 
 
 		 543 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  35.91 
 
 		 525 aa  339  5.9999999999999996e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  36.58 
 
 		 518 aa  337  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  37.05 
 
 		 541 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  38.3 
 
 		 664 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  38.3 
 
 		 666 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  38.56 
 
 		 541 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  38.33 
 
 		 522 aa  333  5e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  38.56 
 
 		 541 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  38.56 
 
 		 541 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  36.99 
 
 		 537 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  38.67 
 
 		 541 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  36.24 
 
 		 541 aa  330  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  36.8 
 
 		 537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  38.4 
 
 		 541 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  36.7 
 
 		 537 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  38.43 
 
 		 541 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  38.24 
 
 		 541 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  36.14 
 
 		 519 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  37.09 
 
 		 642 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  37.09 
 
 		 642 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  36.12 
 
 		 521 aa  305  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  37.65 
 
 		 537 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  35.78 
 
 		 546 aa  303  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  32.77 
 
 		 560 aa  301  2e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  32.58 
 
 		 560 aa  300  4e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  34.71 
 
 		 533 aa  300  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  34.09 
 
 		 531 aa  296  6e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  34.68 
 
 		 542 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  32.89 
 
 		 542 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  32.48 
 
 		 635 aa  290  5.0000000000000004e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  39.44 
 
 		 533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  34.16 
 
 		 528 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  34.16 
 
 		 528 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  32.53 
 
 		 521 aa  273  7e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  34.2 
 
 		 539 aa  266  8e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  34.2 
 
 		 539 aa  266  8e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  32.01 
 
 		 535 aa  263  6e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  33.33 
 
 		 539 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 539 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  35.36 
 
 		 616 aa  258  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  31.06 
 
 		 535 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  35.01 
 
 		 647 aa  253  7e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  32.48 
 
 		 518 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  34.82 
 
 		 630 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  31.31 
 
 		 514 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  37.19 
 
 		 576 aa  238  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  30.23 
 
 		 614 aa  233  5e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  29.37 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  29.8 
 
 		 522 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  29.2 
 
 		 467 aa  162  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 539 aa  159  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 503 aa  152  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 486 aa  125  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25 
 
 		 483 aa  120  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.57 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.57 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.57 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.22 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.55 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.55 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>