More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A1993 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  99.63 
 
 
542 aa  1071    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  100 
 
 
542 aa  1080    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  44.01 
 
 
560 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  44.2 
 
 
560 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  42.12 
 
 
531 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  39.05 
 
 
525 aa  348  1e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  39.05 
 
 
518 aa  347  4e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  36.59 
 
 
533 aa  322  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  37.01 
 
 
521 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  33.46 
 
 
535 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  34.79 
 
 
555 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  33.27 
 
 
532 aa  287  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  32.89 
 
 
532 aa  287  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  32.89 
 
 
532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  34.1 
 
 
546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  33.08 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  33.08 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  33.08 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  33.14 
 
 
535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  33.02 
 
 
533 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  35.29 
 
 
537 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  33.39 
 
 
543 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  34.67 
 
 
533 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  34.67 
 
 
533 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  34.67 
 
 
533 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  34.67 
 
 
533 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  34.59 
 
 
530 aa  279  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  34.23 
 
 
528 aa  277  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  34.23 
 
 
528 aa  277  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 
541 aa  276  5e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  34.13 
 
 
532 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  32.71 
 
 
532 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  32.71 
 
 
532 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  32.71 
 
 
532 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  33.86 
 
 
576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  33.86 
 
 
544 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  34.03 
 
 
546 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  34.35 
 
 
517 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  33.84 
 
 
539 aa  269  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  33.84 
 
 
539 aa  269  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  30.75 
 
 
543 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  32.76 
 
 
539 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  32.76 
 
 
539 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  32.47 
 
 
530 aa  259  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  31.94 
 
 
528 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  35.71 
 
 
530 aa  258  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  31.43 
 
 
533 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  31.74 
 
 
528 aa  256  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  34.37 
 
 
518 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  32.36 
 
 
522 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 
529 aa  242  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  31.11 
 
 
537 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  32.37 
 
 
537 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  31.37 
 
 
537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  31.2 
 
 
543 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  30.79 
 
 
541 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  30.99 
 
 
541 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  32.3 
 
 
514 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  31.87 
 
 
516 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  30.24 
 
 
541 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  30.45 
 
 
666 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  30.37 
 
 
664 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 
541 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 
541 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 
541 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  32.79 
 
 
521 aa  225  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 
541 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 
541 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  30.02 
 
 
642 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  30.02 
 
 
642 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 
541 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  29.88 
 
 
519 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  31.47 
 
 
635 aa  222  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  32.3 
 
 
528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 
536 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  32.15 
 
 
614 aa  209  8e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  26.63 
 
 
559 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 
545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 
545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  30.16 
 
 
647 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  32.03 
 
 
630 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  27.54 
 
 
491 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 
616 aa  189  8e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 
576 aa  159  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 
511 aa  140  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 
467 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  28.09 
 
 
467 aa  136  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.04 
 
 
467 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  28.09 
 
 
467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  28.09 
 
 
467 aa  135  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  28.31 
 
 
467 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.08 
 
 
467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.08 
 
 
467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.08 
 
 
467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  28.04 
 
 
467 aa  134  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 
476 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.42 
 
 
471 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.42 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.2 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.2 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>