More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03682 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  72.18 
 
 		 555 aa  777    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  100 
 
 		 543 aa  1074    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  59.43 
 
 		 528 aa  653    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  59.05 
 
 		 528 aa  650    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  72.81 
 
 		 533 aa  754    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  72.81 
 
 		 533 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  73 
 
 		 533 aa  759    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  73 
 
 		 533 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  72.95 
 
 		 532 aa  738    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  73 
 
 		 533 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  65.18 
 
 		 516 aa  664    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  73.19 
 
 		 543 aa  767    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  63.17 
 
 		 530 aa  647    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  87.45 
 
 		 544 aa  945    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  73.57 
 
 		 533 aa  764    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  73.33 
 
 		 532 aa  723    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  73.27 
 
 		 517 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  72.37 
 
 		 530 aa  761    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  72.95 
 
 		 532 aa  748    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  72.81 
 
 		 533 aa  754    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  73.33 
 
 		 532 aa  724    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  72.74 
 
 		 532 aa  767    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  72.56 
 
 		 532 aa  744    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  87.27 
 
 		 576 aa  944    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  73.33 
 
 		 532 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  72.81 
 
 		 533 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  58.04 
 
 		 530 aa  589  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  46.62 
 
 		 559 aa  484  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  45.09 
 
 		 545 aa  485  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  45.09 
 
 		 545 aa  485  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  46.96 
 
 		 536 aa  476  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  45.62 
 
 		 491 aa  427  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  40.75 
 
 		 529 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  41.25 
 
 		 541 aa  375  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  43.4 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  36.38 
 
 		 543 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  38.61 
 
 		 528 aa  347  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  38.55 
 
 		 541 aa  343  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  38.17 
 
 		 664 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  38.17 
 
 		 541 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  38.17 
 
 		 666 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  37.36 
 
 		 537 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  37.43 
 
 		 537 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  37.08 
 
 		 537 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  37.57 
 
 		 541 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  37.26 
 
 		 522 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  37.38 
 
 		 541 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  37.38 
 
 		 541 aa  326  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  37.4 
 
 		 541 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  37.4 
 
 		 541 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  36.58 
 
 		 525 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  37.4 
 
 		 541 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  37.4 
 
 		 541 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  36.6 
 
 		 518 aa  322  8e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  38.33 
 
 		 521 aa  322  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  36.78 
 
 		 642 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  36.78 
 
 		 519 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  36.78 
 
 		 642 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  33.52 
 
 		 560 aa  307  4.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  33.33 
 
 		 560 aa  306  9.000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  38.14 
 
 		 537 aa  299  9e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  34.74 
 
 		 531 aa  294  4e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  38.89 
 
 		 533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  34.25 
 
 		 521 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  33.6 
 
 		 535 aa  276  7e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  34.15 
 
 		 533 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  34.43 
 
 		 576 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  34.61 
 
 		 546 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  32.65 
 
 		 535 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  37.27 
 
 		 635 aa  269  8.999999999999999e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  30.94 
 
 		 542 aa  269  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  30.75 
 
 		 542 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  35.74 
 
 		 528 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  35.74 
 
 		 528 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  35.19 
 
 		 539 aa  264  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  35.19 
 
 		 539 aa  264  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  33.4 
 
 		 539 aa  259  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 539 aa  259  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  36.54 
 
 		 616 aa  258  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  36.7 
 
 		 630 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  34.35 
 
 		 647 aa  242  1e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  32.35 
 
 		 514 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  32.4 
 
 		 614 aa  224  4e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  30.97 
 
 		 518 aa  221  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 511 aa  159  9e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 		 522 aa  158  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  29.42 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 503 aa  146  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 476 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 496 aa  126  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.27 
 
 		 483 aa  126  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 486 aa  124  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.67 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  24.89 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.67 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  24.89 
 
 		 467 aa  123  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>