More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0469 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  95.75 
 
 
642 aa  1006    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  78.23 
 
 
537 aa  792    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  78.03 
 
 
537 aa  792    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  99.63 
 
 
666 aa  1065    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  95.75 
 
 
519 aa  1008    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  95.75 
 
 
642 aa  1006    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  100 
 
 
664 aa  1070    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  78.12 
 
 
543 aa  816    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  89.65 
 
 
541 aa  927    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  89.83 
 
 
541 aa  934    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  67.76 
 
 
528 aa  655    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  60.89 
 
 
522 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  95.93 
 
 
541 aa  1028    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  74.32 
 
 
521 aa  739    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  100 
 
 
541 aa  1067    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  89.46 
 
 
541 aa  925    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  87.62 
 
 
541 aa  912    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  90 
 
 
541 aa  936    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  87.99 
 
 
541 aa  920    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  78.23 
 
 
537 aa  794    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  89.46 
 
 
541 aa  925    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  54.83 
 
 
529 aa  592  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  38.48 
 
 
544 aa  350  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  38.48 
 
 
576 aa  349  6e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  38.14 
 
 
541 aa  348  2e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  38.17 
 
 
543 aa  342  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  38.93 
 
 
530 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  39.12 
 
 
546 aa  330  3e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  35.89 
 
 
555 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  38.02 
 
 
533 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  38.02 
 
 
533 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  38.02 
 
 
533 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  36.79 
 
 
517 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  37.33 
 
 
532 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  37.36 
 
 
533 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  36.12 
 
 
543 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  37.64 
 
 
533 aa  320  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  37.64 
 
 
533 aa  320  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  37.64 
 
 
533 aa  320  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  37.64 
 
 
533 aa  320  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  37.5 
 
 
532 aa  319  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  35.81 
 
 
530 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  33.78 
 
 
528 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  36.48 
 
 
532 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  33.4 
 
 
528 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  37.33 
 
 
532 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  37.33 
 
 
532 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  37.33 
 
 
532 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  37.33 
 
 
532 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  37.1 
 
 
516 aa  295  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  35.29 
 
 
530 aa  288  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  33.91 
 
 
525 aa  280  3e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  33.91 
 
 
518 aa  280  6e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  36.19 
 
 
537 aa  276  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  31.01 
 
 
545 aa  274  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  31.01 
 
 
545 aa  274  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  32.35 
 
 
536 aa  269  8e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  30.29 
 
 
559 aa  266  7e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  35.5 
 
 
546 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  37.2 
 
 
533 aa  258  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  32.11 
 
 
528 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  32.11 
 
 
528 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  29.67 
 
 
616 aa  251  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  33.4 
 
 
539 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 
539 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  30.24 
 
 
491 aa  244  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  35.55 
 
 
531 aa  240  5e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  35.36 
 
 
635 aa  237  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  30.08 
 
 
521 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  33.52 
 
 
630 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  30.96 
 
 
539 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  30.96 
 
 
539 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  31.02 
 
 
533 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  30.28 
 
 
542 aa  229  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  32.19 
 
 
560 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  32.19 
 
 
560 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  30.24 
 
 
542 aa  226  9e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  28.02 
 
 
535 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  33.85 
 
 
614 aa  208  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  28.83 
 
 
535 aa  206  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  28 
 
 
518 aa  205  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  32.16 
 
 
647 aa  199  9e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  31.52 
 
 
514 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 
511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 
576 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 
539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  28.94 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 
522 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.71 
 
 
467 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.48 
 
 
467 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.48 
 
 
467 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.48 
 
 
467 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.48 
 
 
467 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.71 
 
 
467 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  29.88 
 
 
503 aa  125  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.76 
 
 
467 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 
471 aa  124  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  29.4 
 
 
471 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  29.4 
 
 
471 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  29.4 
 
 
471 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>