More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1474 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  100 
 
 
445 aa  878    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  36.34 
 
 
439 aa  236  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  31.08 
 
 
522 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  32.41 
 
 
469 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  33.19 
 
 
499 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  30.23 
 
 
489 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  30.54 
 
 
485 aa  209  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  30.53 
 
 
461 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  33.19 
 
 
472 aa  202  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  33.12 
 
 
473 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  30.9 
 
 
473 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  32.52 
 
 
495 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  31.13 
 
 
490 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  31.17 
 
 
452 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  31.83 
 
 
474 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  29.51 
 
 
482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  30.63 
 
 
443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 
484 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 
467 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  31.48 
 
 
440 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  31.41 
 
 
448 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  30.64 
 
 
452 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 
463 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 
453 aa  162  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  28.98 
 
 
443 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 
440 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 
440 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 
435 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  28.35 
 
 
580 aa  155  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  26.93 
 
 
437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  26.93 
 
 
438 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  26.93 
 
 
438 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  26.93 
 
 
437 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  28.18 
 
 
438 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  26.93 
 
 
438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  26.93 
 
 
438 aa  146  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  26.93 
 
 
438 aa  146  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 
437 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 
447 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 
444 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  29.46 
 
 
440 aa  136  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  29.71 
 
 
426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  25.46 
 
 
609 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  25.78 
 
 
452 aa  134  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2830  amino acid permease family protein  30.61 
 
 
430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  28.16 
 
 
463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 
471 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  30.05 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 
429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 
454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  27.1 
 
 
458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  29.35 
 
 
433 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.54 
 
 
471 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.54 
 
 
471 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.54 
 
 
471 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.54 
 
 
471 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  24.95 
 
 
471 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  25.76 
 
 
471 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  26.19 
 
 
471 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  25.76 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25 
 
 
471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25 
 
 
471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25 
 
 
471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25 
 
 
471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25 
 
 
471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  25.76 
 
 
471 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  27.6 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25 
 
 
471 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  25.76 
 
 
471 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.78 
 
 
471 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 
382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  24.95 
 
 
471 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  25.61 
 
 
462 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  25.99 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  25.99 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  25.99 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  25.99 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  25.99 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  25.99 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  29.75 
 
 
421 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 
427 aa  106  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 
439 aa  106  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27 
 
 
436 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 
441 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.73 
 
 
467 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.73 
 
 
467 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 
473 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  30.12 
 
 
451 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  28.28 
 
 
431 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 
515 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  24.73 
 
 
467 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  24.73 
 
 
467 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  30.12 
 
 
451 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  24.52 
 
 
467 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  24.52 
 
 
467 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  24.95 
 
 
467 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>