More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0567 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  100 
 
 		 452 aa  882    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  50.23 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  50.23 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  38.46 
 
 		 453 aa  288  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  37.07 
 
 		 443 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  34.82 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  37.56 
 
 		 438 aa  254  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  37.33 
 
 		 438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  37.33 
 
 		 438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  37.33 
 
 		 438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  37.73 
 
 		 437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  37.73 
 
 		 437 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  37.41 
 
 		 437 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  37.33 
 
 		 438 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  37.33 
 
 		 438 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  36.96 
 
 		 435 aa  251  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  36.49 
 
 		 442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  29.91 
 
 		 461 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  36.81 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  29.25 
 
 		 452 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  29.09 
 
 		 485 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 469 aa  186  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 467 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  29.38 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  27.44 
 
 		 522 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  29.09 
 
 		 473 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  25.91 
 
 		 489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 474 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  26.13 
 
 		 445 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 		 490 aa  156  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  26.28 
 
 		 609 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  26.64 
 
 		 440 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  25.27 
 
 		 580 aa  149  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  29.48 
 
 		 495 aa  149  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  27.12 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  30.06 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 448 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 482 aa  133  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0924  amino acid permease-associated region  30.72 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 454 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  28.39 
 
 		 471 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  28.05 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  28.09 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  28.09 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  28.09 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  28.76 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  25 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  24.44 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 486 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  24.35 
 
 		 462 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  24.35 
 
 		 462 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  24.22 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  24.22 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  24.22 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  24.22 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  28.51 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  28.51 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  28.08 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  28.08 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  28.08 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  28.08 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  28.08 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 490 aa  119  7.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08538  amino acid transporter (Eurofung)  27.06 
 
 		 507 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 770 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 786 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  28.35 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  28.12 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  27.68 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  25.92 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  27.54 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  27.7 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  24.83 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  27.68 
 
 		 471 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 745 aa  113  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.28 
 
 		 467 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  27.13 
 
 		 471 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.56 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  24.44 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  24.44 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.56 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  24.89 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>