More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1252 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  100 
 
 
484 aa  959    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  43.23 
 
 
463 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  41.27 
 
 
447 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  39.04 
 
 
447 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  42.73 
 
 
495 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  35.6 
 
 
452 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  36.59 
 
 
458 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  31.57 
 
 
461 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2830  amino acid permease family protein  37.83 
 
 
430 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  31.38 
 
 
485 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  34.05 
 
 
489 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 
469 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  30.06 
 
 
522 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  30.55 
 
 
499 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  36.96 
 
 
473 aa  205  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  32.06 
 
 
439 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  31.68 
 
 
490 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  32.03 
 
 
474 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  30.48 
 
 
473 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  31.44 
 
 
445 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  31.43 
 
 
472 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  31.64 
 
 
440 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  29.56 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  30.41 
 
 
463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 
444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 
467 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  27.79 
 
 
480 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 
448 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  28.95 
 
 
580 aa  159  9e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 
443 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  28.57 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  28.25 
 
 
454 aa  154  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 
437 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  26.81 
 
 
437 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 
435 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  26.61 
 
 
438 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  26.61 
 
 
438 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  26.61 
 
 
437 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  26.4 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  26.4 
 
 
438 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  26.4 
 
 
438 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  26.4 
 
 
438 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 
482 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 
440 aa  144  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 
440 aa  144  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  25.99 
 
 
609 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  26.55 
 
 
445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 
453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  26.33 
 
 
462 aa  140  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  26.33 
 
 
462 aa  140  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  26.33 
 
 
445 aa  140  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.473347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  26.33 
 
 
445 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 
445 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  26.33 
 
 
445 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  26.33 
 
 
462 aa  139  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 
382 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  26.14 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  28.07 
 
 
486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 
452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.59 
 
 
471 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  27.66 
 
 
486 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  27.66 
 
 
486 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 
491 aa  128  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 
471 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.85 
 
 
471 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.85 
 
 
471 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.85 
 
 
471 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.85 
 
 
471 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.85 
 
 
471 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.64 
 
 
471 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.08 
 
 
471 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 
506 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28954  very low affinity methionine permease  29.5 
 
 
550 aa  123  7e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144807  normal  0.597745 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 
518 aa  123  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  25.48 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 
441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 
476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  29.07 
 
 
488 aa  120  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.63 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.63 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.63 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 
491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  26.21 
 
 
387 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  26.1 
 
 
440 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  26.45 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.64 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.24 
 
 
471 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  26.76 
 
 
471 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 
576 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 
442 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 
501 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 
496 aa  113  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  24.94 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 
544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  25.17 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  25.17 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.71 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.71 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>