More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4660 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  100 
 
 
467 aa  922    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  60.88 
 
 
452 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  50.68 
 
 
452 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  46.62 
 
 
448 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  40.36 
 
 
454 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  37.83 
 
 
482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  34.78 
 
 
452 aa  217  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  30.45 
 
 
489 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  30.62 
 
 
461 aa  193  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  35.93 
 
 
439 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  30.98 
 
 
485 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  29.12 
 
 
445 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  30 
 
 
469 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  34.26 
 
 
495 aa  180  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  28.34 
 
 
499 aa  179  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  31.13 
 
 
580 aa  178  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  30.37 
 
 
473 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 
473 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  27.94 
 
 
522 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 
444 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 
490 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 
447 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 
443 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  30.03 
 
 
440 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 
474 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  29.56 
 
 
472 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
484 aa  153  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 
447 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.480186 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  27.56 
 
 
609 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 
440 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 
440 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  29.56 
 
 
452 aa  151  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  26.62 
 
 
458 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 
435 aa  148  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 
437 aa  147  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 
453 aa  146  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  25.81 
 
 
437 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  25.71 
 
 
437 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  25.6 
 
 
438 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  25.6 
 
 
438 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  25.6 
 
 
438 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  25.49 
 
 
438 aa  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  25.38 
 
 
438 aa  143  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  25.38 
 
 
438 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  27.18 
 
 
480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 
463 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 
770 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 
463 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  26.36 
 
 
443 aa  124  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 
436 aa  118  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 
439 aa  118  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  27.65 
 
 
462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  24.81 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 
764 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  27.37 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  27.37 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  27.37 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  27.37 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  27.37 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  27.37 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  26.22 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 
745 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 
786 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 
382 aa  106  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  26.91 
 
 
753 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 
494 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 
429 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.23 
 
 
489 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 
474 aa  100  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 
473 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 
503 aa  99  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08538  amino acid transporter (Eurofung)  25.83 
 
 
507 aa  97.1  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 
441 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 
471 aa  97.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 
471 aa  96.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 
458 aa  95.9  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.18 
 
 
471 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.18 
 
 
471 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.18 
 
 
471 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.18 
 
 
471 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  25.06 
 
 
422 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.18 
 
 
471 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.94 
 
 
471 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 
457 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.83 
 
 
471 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.94 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.06 
 
 
471 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 
538 aa  94.4  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 
475 aa  93.6  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 
482 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 
482 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.15 
 
 
471 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 
479 aa  92.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.15 
 
 
471 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.15 
 
 
471 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 
433 aa  92.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 
500 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 
472 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>