More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2442 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 441 aa  885    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  60 
 
 		 457 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  41.05 
 
 		 480 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  28.14 
 
 		 485 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  24.89 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  26.88 
 
 		 431 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  26.88 
 
 		 431 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  26.39 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  25.23 
 
 		 440 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  25.45 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  24.67 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25 
 
 		 440 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  25.38 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  25.61 
 
 		 462 aa  103  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  25.61 
 
 		 462 aa  103  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  25.61 
 
 		 445 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  25.61 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  25.61 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  25.61 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  25.37 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  23.18 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  25.28 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 490 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 452 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  23.58 
 
 		 469 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 		 740 aa  94  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  25.28 
 
 		 580 aa  93.6  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 467 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 463 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  23.46 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 764 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  22.76 
 
 		 461 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 473 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  22.74 
 
 		 495 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 488 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 495 aa  90.1  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 474 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 473 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 716 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  21.58 
 
 		 456 aa  87.8  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  28.03 
 
 		 753 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 447 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 482 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  22.51 
 
 		 518 aa  87  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  23.41 
 
 		 491 aa  87.4  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24 
 
 		 486 aa  87  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  19.17 
 
 		 471 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  24.69 
 
 		 528 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 770 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  22.96 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4398  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 488 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  22.44 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  21.59 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 745 aa  83.2  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  24.23 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  24.23 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  24.23 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  22.96 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  21.41 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  26 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  22.88 
 
 		 529 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  23.96 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  23.74 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1325  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  23.74 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  23.51 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  23.74 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  21.52 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  23.56 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  23.56 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  23.74 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.15 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  23.65 
 
 		 609 aa  80.1  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  24.03 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4510  amino acid permease-associated region  23.17 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  21.18 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  23.74 
 
 		 528 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  24.2 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  20.91 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  22.67 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>