More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2701 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  100 
 
 		 489 aa  984    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  34.3 
 
 		 522 aa  296  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  35.53 
 
 		 469 aa  293  7e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  36.59 
 
 		 485 aa  289  8e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  36.15 
 
 		 473 aa  286  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  34.8 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  39.56 
 
 		 439 aa  282  9e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  33.74 
 
 		 490 aa  272  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  36.9 
 
 		 461 aa  269  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  35.94 
 
 		 452 aa  269  8.999999999999999e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  38.12 
 
 		 495 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  32.84 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  36.54 
 
 		 473 aa  239  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  33.63 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  35.7 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  30.66 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  33.83 
 
 		 484 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  32.91 
 
 		 463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  30.2 
 
 		 467 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  32.29 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  30.36 
 
 		 482 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  31.4 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  30.73 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  30.51 
 
 		 437 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  29.89 
 
 		 438 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  29.89 
 
 		 438 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 440 aa  176  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 440 aa  176  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  29.82 
 
 		 438 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  29.89 
 
 		 438 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  29.89 
 
 		 438 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 		 437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  29.66 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  28.92 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  30.32 
 
 		 453 aa  169  9e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  27.54 
 
 		 458 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 447 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  29.75 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  27.79 
 
 		 580 aa  152  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  29.77 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  28.76 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.72 
 
 		 489 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 454 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  25.73 
 
 		 609 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  25.16 
 
 		 452 aa  138  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  29.72 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 452 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  27.09 
 
 		 483 aa  133  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  26.9 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  26.68 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  26.68 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  26.68 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  26.68 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 490 aa  129  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  26.68 
 
 		 445 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 457 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  26.46 
 
 		 462 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  28.94 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2830  amino acid permease family protein  28.11 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  29.75 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  26.33 
 
 		 471 aa  120  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.33 
 
 		 471 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  25.75 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  25.75 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.46 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 		 488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27 
 
 		 460 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  26.65 
 
 		 503 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 770 aa  116  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 786 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.38 
 
 		 486 aa  114  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.38 
 
 		 486 aa  114  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 		 506 aa  113  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 476 aa  113  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  26.52 
 
 		 426 aa  113  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.27 
 
 		 476 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  28.68 
 
 		 503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 500 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 518 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.49 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  25.94 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 		 501 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.43 
 
 		 463 aa  110  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>