More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2279 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 382 aa  756    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  38.21 
 
 		 444 aa  246  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  36.84 
 
 		 463 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  27.44 
 
 		 473 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 490 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 447 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 		 469 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 474 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  27.27 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 440 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 440 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 473 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  24.06 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 499 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  24.48 
 
 		 489 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  25.47 
 
 		 445 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  26.46 
 
 		 458 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  29.52 
 
 		 461 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  25 
 
 		 522 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  23.94 
 
 		 440 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  24.15 
 
 		 452 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  24.12 
 
 		 451 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  25.82 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  29.54 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 452 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 495 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  23.53 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 786 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  27.15 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  28.8 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  28.53 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  28.53 
 
 		 437 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  22.94 
 
 		 609 aa  99.8  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  28.53 
 
 		 437 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  28.53 
 
 		 438 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  28.53 
 
 		 438 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  29.2 
 
 		 467 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  23.67 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  29.2 
 
 		 467 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  29.2 
 
 		 467 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  28.53 
 
 		 438 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 467 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 474 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  28.53 
 
 		 438 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  28.53 
 
 		 438 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 770 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  23.94 
 
 		 470 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  27.38 
 
 		 467 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 479 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  27.87 
 
 		 479 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  24.2 
 
 		 470 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  24.2 
 
 		 470 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  27.8 
 
 		 479 aa  97.1  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 		 454 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  23.4 
 
 		 470 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 473 aa  96.7  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  23.94 
 
 		 470 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 474 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  23.67 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  27.57 
 
 		 479 aa  93.6  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  23.73 
 
 		 467 aa  93.6  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  23.5 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 472 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  24.73 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  23.61 
 
 		 469 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  23.61 
 
 		 469 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  23.43 
 
 		 462 aa  91.3  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  23.61 
 
 		 469 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  23.61 
 
 		 469 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  23.61 
 
 		 469 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  23.61 
 
 		 469 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  23.16 
 
 		 445 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  23.16 
 
 		 462 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  23.16 
 
 		 445 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  23.16 
 
 		 462 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  23.16 
 
 		 445 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  23.67 
 
 		 463 aa  90.1  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  23.22 
 
 		 445 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  24.51 
 
 		 482 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  24.61 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  28 
 
 		 479 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  22.19 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  26.6 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  23.16 
 
 		 467 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  23.34 
 
 		 469 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  23.68 
 
 		 477 aa  87  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  22.89 
 
 		 445 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  23.84 
 
 		 456 aa  87  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  24.05 
 
 		 445 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 764 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  30.14 
 
 		 476 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  21.54 
 
 		 467 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>