More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2931 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  80.35 
 
 
467 aa  749    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  82.62 
 
 
490 aa  679    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  76.57 
 
 
479 aa  727    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  100 
 
 
479 aa  941    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  80.35 
 
 
467 aa  749    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  83.12 
 
 
479 aa  719    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  82.44 
 
 
469 aa  706    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  80.35 
 
 
467 aa  749    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  70.49 
 
 
488 aa  613  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  62.55 
 
 
482 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  62.55 
 
 
482 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  63.03 
 
 
482 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  63.25 
 
 
482 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  62 
 
 
482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  62 
 
 
482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  61.95 
 
 
480 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  60.66 
 
 
483 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  58.66 
 
 
486 aa  538  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  58.15 
 
 
468 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  60.93 
 
 
471 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  55.22 
 
 
467 aa  501  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  58.15 
 
 
486 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  53.43 
 
 
463 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  49.13 
 
 
467 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  44.89 
 
 
499 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  42.83 
 
 
509 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  42.83 
 
 
509 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  42.83 
 
 
509 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  42.57 
 
 
500 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  44.74 
 
 
485 aa  312  9e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  40.45 
 
 
505 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  41.78 
 
 
497 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  35.7 
 
 
445 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  37.55 
 
 
467 aa  253  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  37.34 
 
 
467 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  35.65 
 
 
441 aa  249  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  36.22 
 
 
477 aa  243  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  35.81 
 
 
467 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  36.85 
 
 
463 aa  232  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  39.52 
 
 
474 aa  231  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  37.36 
 
 
470 aa  230  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  36.86 
 
 
469 aa  229  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  36.3 
 
 
454 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  36.71 
 
 
454 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  34.79 
 
 
470 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  36.82 
 
 
456 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  37.72 
 
 
463 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  34.21 
 
 
470 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  37.93 
 
 
458 aa  226  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  34.21 
 
 
461 aa  226  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  36.01 
 
 
467 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  35.84 
 
 
469 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  33.99 
 
 
470 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  33.99 
 
 
470 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  34.21 
 
 
470 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  35.37 
 
 
470 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  37.93 
 
 
456 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  35.39 
 
 
469 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  35.39 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  35.39 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  37.14 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  35.39 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  35.39 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  35.39 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  35.39 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  37.68 
 
 
458 aa  220  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  37.89 
 
 
455 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  37.25 
 
 
470 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  36.82 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  36.48 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  36.61 
 
 
454 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  35.92 
 
 
495 aa  213  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  36.45 
 
 
457 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  37.36 
 
 
473 aa  213  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  37.78 
 
 
443 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  34.22 
 
 
445 aa  200  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  32.89 
 
 
467 aa  136  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  29.47 
 
 
456 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  29.56 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 
491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 
515 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 
465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 
516 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 
475 aa  110  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  30.09 
 
 
460 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  25.72 
 
 
476 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.03 
 
 
467 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.03 
 
 
467 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.03 
 
 
467 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.03 
 
 
467 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.87 
 
 
460 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.8 
 
 
467 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.03 
 
 
467 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 
468 aa  107  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.8 
 
 
467 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.03 
 
 
467 aa  106  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 
480 aa  106  9e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  27.57 
 
 
467 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  28.5 
 
 
543 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>