More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2040 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  100 
 
 		 479 aa  952    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02690  putative amino acid permease  55.48 
 
 		 477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0306  amino acid permease  55.48 
 
 		 477 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  51.54 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0458  amino acid permease-associated region  49.55 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  32.11 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  31.79 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  32.11 
 
 		 494 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  32.11 
 
 		 494 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1276  amino acid transporters  32.18 
 
 		 496 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104597  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1363  amino acid permease  32.18 
 
 		 467 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0626  amino acid permease  32.18 
 
 		 496 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0945  amino acid permease  32.18 
 
 		 496 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0346  amino acid permease  32.18 
 
 		 496 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362616  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1203  amino acid permease  32.69 
 
 		 496 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439752  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1535  amino acid permease  31.1 
 
 		 496 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2468  amino acid permease  32.18 
 
 		 496 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  31.91 
 
 		 500 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  31.91 
 
 		 500 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3822  amino acid permease-associated region  32.04 
 
 		 499 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3512  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 498 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  normal  0.430262 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3470  amino acid permease  29.98 
 
 		 499 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.202942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3368  transporter  29.77 
 
 		 499 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3301  transpoter  29.77 
 
 		 499 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0619  amino acid permease-associated region  29.73 
 
 		 497 aa  196  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3375  transporter  29.77 
 
 		 499 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.635182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3296  transpoter  29.77 
 
 		 499 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1029  amino acid permease  29.16 
 
 		 497 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11210  putative amino acid permease  28.3 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.878559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3628  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 451 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0216895  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 436 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  29.54 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  27.35 
 
 		 445 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  29.31 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.13 
 
 		 422 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  29.81 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  29.81 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  29.02 
 
 		 467 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  30.21 
 
 		 477 aa  107  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  29.31 
 
 		 470 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  29.81 
 
 		 470 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  29.08 
 
 		 470 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  27.49 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 494 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 468 aa  104  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  28.61 
 
 		 463 aa  104  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  28.22 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 		 770 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 786 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  26.75 
 
 		 469 aa  103  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  27.53 
 
 		 467 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  28.34 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  27.51 
 
 		 473 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  27.83 
 
 		 467 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  26.52 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  28.8 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  27.61 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  28.8 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  28.8 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  28.8 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  28.8 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  28.8 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 773 aa  98.2  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 455 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 452 aa  97.8  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  28.9 
 
 		 469 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 474 aa  97.1  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 483 aa  97.1  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  26.57 
 
 		 455 aa  97.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  28.03 
 
 		 457 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 481 aa  96.7  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  27.78 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 483 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 716 aa  96.3  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 486 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 474 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 473 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  25.84 
 
 		 463 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  25.84 
 
 		 463 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  25.84 
 
 		 463 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  25.84 
 
 		 463 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 509 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  28.57 
 
 		 469 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 509 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 509 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  26.03 
 
 		 528 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 382 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  25.41 
 
 		 463 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  27.77 
 
 		 454 aa  94  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1095  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 455 aa  94  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 725 aa  93.6  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  25.12 
 
 		 467 aa  93.6  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  27.76 
 
 		 466 aa  93.2  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0732  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 455 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 538 aa  93.2  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>