More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1266 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 474 aa  911    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  72.28 
 
 		 473 aa  646    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  65.89 
 
 		 475 aa  552  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  64.32 
 
 		 479 aa  541  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  43.27 
 
 		 770 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  45.03 
 
 		 764 aa  320  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  43.86 
 
 		 786 aa  316  5e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  44.15 
 
 		 745 aa  302  8.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  38.08 
 
 		 820 aa  259  7e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  39.29 
 
 		 792 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  35.15 
 
 		 753 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  36.88 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  34.98 
 
 		 740 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 773 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  32.82 
 
 		 641 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  34.9 
 
 		 716 aa  196  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  32.97 
 
 		 725 aa  188  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  34.38 
 
 		 796 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1905  amino acid permease-associated region  32.61 
 
 		 812 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  31.97 
 
 		 488 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4398  amino acid permease-associated region  33.03 
 
 		 488 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  32.14 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.72 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  29.33 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 490 aa  143  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  30.18 
 
 		 515 aa  143  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4510  amino acid permease-associated region  32.86 
 
 		 505 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  28.94 
 
 		 506 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  30.5 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 549 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  28.97 
 
 		 483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 486 aa  136  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 491 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  29.64 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  29.23 
 
 		 486 aa  133  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  29.23 
 
 		 486 aa  133  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.84 
 
 		 467 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.25 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.25 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.25 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  27.07 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  30.69 
 
 		 492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  26.67 
 
 		 463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  27.31 
 
 		 463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.73 
 
 		 467 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.73 
 
 		 467 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  29.82 
 
 		 495 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 		 491 aa  129  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  30.85 
 
 		 515 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  29.85 
 
 		 496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 		 494 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  27.92 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 476 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.51 
 
 		 467 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.92 
 
 		 467 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  24.71 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  28.45 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.82 
 
 		 467 aa  126  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  28.66 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  25.42 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  24.71 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  24.94 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 		 496 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  31.15 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  28.71 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 		 496 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  26.45 
 
 		 503 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 495 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 566 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 465 aa  123  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.94 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  27.31 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  24.94 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.17 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  31.72 
 
 		 538 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.93 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  26.22 
 
 		 476 aa  121  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 496 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  26.56 
 
 		 471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  26.56 
 
 		 471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 		 489 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  27.06 
 
 		 512 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  26.09 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.57 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.57 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.34 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.57 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>