More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2730 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 725 aa  1422    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  56.62 
 
 		 716 aa  718    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  43.97 
 
 		 773 aa  548  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  44.41 
 
 		 740 aa  533  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  52.15 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  45.96 
 
 		 641 aa  349  9e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  32.08 
 
 		 753 aa  343  9e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  33.74 
 
 		 764 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  34.98 
 
 		 770 aa  306  8.000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  32.77 
 
 		 786 aa  296  7e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  31.58 
 
 		 745 aa  282  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 820 aa  265  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  32.19 
 
 		 792 aa  236  9e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  35.59 
 
 		 473 aa  229  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  32.97 
 
 		 474 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  34.62 
 
 		 475 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  34.32 
 
 		 479 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  29.38 
 
 		 489 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  30.93 
 
 		 494 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.45 
 
 		 500 aa  153  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  29.24 
 
 		 500 aa  151  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 506 aa  148  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 		 538 aa  147  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  28.86 
 
 		 476 aa  147  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 		 796 aa  146  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 		 476 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 471 aa  143  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.62 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.62 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 518 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.86 
 
 		 471 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.86 
 
 		 471 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.86 
 
 		 471 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.86 
 
 		 471 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.86 
 
 		 471 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.86 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 481 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.86 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 488 aa  137  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 495 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 485 aa  135  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 490 aa  135  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  26.75 
 
 		 525 aa  135  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 518 aa  134  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 491 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  26.83 
 
 		 460 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  27.59 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  27.59 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  27.49 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.96 
 
 		 471 aa  132  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 495 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 517 aa  131  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  27.15 
 
 		 471 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  27.15 
 
 		 471 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  27.15 
 
 		 471 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 439 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  27.09 
 
 		 486 aa  130  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.97 
 
 		 467 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.15 
 
 		 467 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.76 
 
 		 471 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.01 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43398  APC family transporter: amino acid  28.61 
 
 		 506 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.01 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.97 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.97 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  28.51 
 
 		 460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 423 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.31 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.58 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.68 
 
 		 467 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.31 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.11 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  31.25 
 
 		 441 aa  128  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  27.97 
 
 		 471 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.74 
 
 		 467 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 467 aa  128  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 496 aa  127  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 496 aa  127  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  27.39 
 
 		 471 aa  127  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  27.39 
 
 		 471 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  27.17 
 
 		 471 aa  127  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.97 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0344  amino acid permease family protein  31.23 
 
 		 465 aa  126  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  26.3 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  28.88 
 
 		 543 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  28.34 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  27.13 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 491 aa  125  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  29.45 
 
 		 488 aa  125  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 		 481 aa  125  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3585  amino acid permease-associated region  31.41 
 
 		 764 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 		 549 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  26.87 
 
 		 485 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 456 aa  124  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  28.71 
 
 		 464 aa  124  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>