More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1095 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  100 
 
 
441 aa  867    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  99.08 
 
 
437 aa  847    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  65.81 
 
 
431 aa  525  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  65.34 
 
 
431 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  56.18 
 
 
433 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  36.74 
 
 
427 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  36.01 
 
 
418 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  37.65 
 
 
419 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  35.6 
 
 
440 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  31.92 
 
 
436 aa  177  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  33.72 
 
 
423 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  34.31 
 
 
428 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  32.85 
 
 
421 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  36.07 
 
 
423 aa  168  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  29.41 
 
 
489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  37.16 
 
 
438 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 
439 aa  162  9e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  36.93 
 
 
408 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  29.43 
 
 
449 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  29.78 
 
 
467 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  29.78 
 
 
467 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  29.78 
 
 
467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  29.57 
 
 
467 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  29.51 
 
 
467 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  29.57 
 
 
467 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  29.57 
 
 
467 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  30.5 
 
 
471 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  30.28 
 
 
471 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 
471 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  29.96 
 
 
467 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  30.28 
 
 
471 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  30.28 
 
 
471 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  30.28 
 
 
471 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  30.28 
 
 
471 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  30.28 
 
 
471 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 
495 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 
506 aa  149  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  29.21 
 
 
467 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  29.4 
 
 
495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  30.11 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  36.34 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  36.34 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  36.34 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  30.36 
 
 
471 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 
494 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  32.75 
 
 
467 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  29.05 
 
 
486 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  37.14 
 
 
430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  29.39 
 
 
471 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  28.63 
 
 
497 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 
495 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  30.25 
 
 
491 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  29.39 
 
 
471 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  34.16 
 
 
418 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  29.26 
 
 
518 aa  143  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.13 
 
 
422 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 
494 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  28.96 
 
 
471 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  29.18 
 
 
471 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  28.28 
 
 
542 aa  140  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  29.59 
 
 
460 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  30.34 
 
 
471 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 
476 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  29.61 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  30.2 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  29.68 
 
 
466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  29.61 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  29.61 
 
 
466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 
510 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 
490 aa  137  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  28.88 
 
 
525 aa  136  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 
456 aa  136  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  28.94 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  28.94 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  28.94 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  31.95 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  31.95 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  29.27 
 
 
477 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  29.63 
 
 
471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  31.8 
 
 
474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  29.63 
 
 
471 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  29.37 
 
 
467 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  29.37 
 
 
467 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  29.37 
 
 
467 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  29.37 
 
 
467 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  29.37 
 
 
467 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  29.37 
 
 
467 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  29.37 
 
 
467 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  29.67 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1055  amino acid permease-associated region  35.98 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123493  hitchhiker  0.0000000766356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  29.17 
 
 
471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  31.35 
 
 
465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  29.15 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 
486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  29.62 
 
 
773 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  28.54 
 
 
468 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  31.89 
 
 
716 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 
764 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>