More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0692 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  50.31 
 
 
786 aa  751    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  100 
 
 
820 aa  1629    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  50.32 
 
 
745 aa  721    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  65.39 
 
 
764 aa  1005    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  52.12 
 
 
770 aa  774    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  37.15 
 
 
792 aa  419  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  32.51 
 
 
716 aa  328  4.0000000000000003e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  33.67 
 
 
740 aa  327  6e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  47.84 
 
 
625 aa  312  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  29.96 
 
 
753 aa  302  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  41.71 
 
 
732 aa  298  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  39.12 
 
 
474 aa  286  8e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 
473 aa  283  7.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  33.48 
 
 
725 aa  279  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 
773 aa  277  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  40.25 
 
 
475 aa  270  5e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  40.08 
 
 
479 aa  263  8e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  35.99 
 
 
465 aa  260  9e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  50.91 
 
 
604 aa  257  7e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  33.68 
 
 
641 aa  233  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 
506 aa  178  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  30.19 
 
 
471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  29.56 
 
 
471 aa  173  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  29.77 
 
 
471 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  29.77 
 
 
471 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  29.77 
 
 
471 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  29.98 
 
 
471 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  29.77 
 
 
471 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  29.77 
 
 
471 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 
471 aa  171  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 
471 aa  171  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 
486 aa  169  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.16 
 
 
476 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  27.24 
 
 
796 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  29.71 
 
 
471 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  29.14 
 
 
471 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  28.36 
 
 
467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  28.15 
 
 
467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  28.36 
 
 
467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.15 
 
 
467 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.57 
 
 
467 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  28.15 
 
 
467 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  28.03 
 
 
467 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 
500 aa  164  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.31 
 
 
476 aa  163  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  30.25 
 
 
518 aa  163  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  27.94 
 
 
467 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  27.94 
 
 
467 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  28.51 
 
 
471 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
494 aa  160  9e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  28.31 
 
 
471 aa  160  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  28.33 
 
 
471 aa  159  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 
496 aa  159  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 
496 aa  159  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  28.33 
 
 
471 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 
495 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  27.88 
 
 
471 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  27.88 
 
 
471 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 
476 aa  158  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  27.88 
 
 
471 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  28.05 
 
 
485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.16 
 
 
468 aa  155  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 
495 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 
468 aa  155  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.16 
 
 
468 aa  155  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 
467 aa  154  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 
466 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 
466 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 
469 aa  153  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.99 
 
 
489 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  27.46 
 
 
471 aa  153  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  27.67 
 
 
471 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 
466 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  29.41 
 
 
465 aa  152  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  28.78 
 
 
467 aa  152  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 
456 aa  151  4e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  27.46 
 
 
471 aa  151  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  27.67 
 
 
471 aa  150  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 
501 aa  150  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 
486 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.94 
 
 
468 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 
466 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  28.78 
 
 
467 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  28.78 
 
 
467 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  27.46 
 
 
471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  28.78 
 
 
467 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  28.78 
 
 
467 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  28.78 
 
 
467 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  28.22 
 
 
460 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  28.2 
 
 
504 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  28.78 
 
 
467 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  28.78 
 
 
467 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 
495 aa  148  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  28.78 
 
 
463 aa  147  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  30.11 
 
 
483 aa  147  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  28.03 
 
 
463 aa  147  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  28 
 
 
462 aa  147  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 
482 aa  146  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  31.16 
 
 
473 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  28.72 
 
 
465 aa  145  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>