More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1073 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  76.33 
 
 
479 aa  673    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  100 
 
 
475 aa  912    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  69.92 
 
 
473 aa  631  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  65.89 
 
 
474 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  45.18 
 
 
770 aa  331  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  45.49 
 
 
764 aa  323  4e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  44.93 
 
 
786 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  42.98 
 
 
745 aa  298  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  39.83 
 
 
820 aa  263  4e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  40.66 
 
 
792 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  38.75 
 
 
740 aa  249  7e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  35.54 
 
 
753 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  37.59 
 
 
465 aa  226  8e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  34.32 
 
 
716 aa  211  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  36.05 
 
 
773 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  34.39 
 
 
725 aa  207  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  32.67 
 
 
641 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  33.48 
 
 
796 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1905  amino acid permease-associated region  32.48 
 
 
812 aa  161  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  32.27 
 
 
518 aa  158  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  33.09 
 
 
506 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  30 
 
 
483 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  32.35 
 
 
464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  30.15 
 
 
496 aa  146  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  30.32 
 
 
491 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  31.63 
 
 
476 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.75 
 
 
489 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  29.78 
 
 
488 aa  143  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 
476 aa  143  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 
494 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 
520 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  31.83 
 
 
488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  29.78 
 
 
486 aa  137  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 
549 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  28.78 
 
 
486 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  28.78 
 
 
486 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 
515 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.89 
 
 
467 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 
566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  27.23 
 
 
471 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  27.23 
 
 
471 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  27.23 
 
 
471 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 
490 aa  132  9e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  26.64 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  29.47 
 
 
476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  28.41 
 
 
495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.19 
 
 
467 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4510  amino acid permease-associated region  31.57 
 
 
505 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.338934 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.19 
 
 
467 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  31.86 
 
 
423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  28.84 
 
 
467 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  28.35 
 
 
476 aa  130  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  28.25 
 
 
471 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  28.61 
 
 
467 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.19 
 
 
467 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  28.25 
 
 
471 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  26.91 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 
444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  27 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3585  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 
764 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236231 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  28.61 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4398  amino acid permease-associated region  31.25 
 
 
488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 
510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 
500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  27.15 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  27.91 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  30.7 
 
 
538 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  26.68 
 
 
471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  26.68 
 
 
471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  30.19 
 
 
465 aa  127  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  31.57 
 
 
469 aa  126  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  27.16 
 
 
483 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  28.44 
 
 
471 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.92 
 
 
471 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  30.47 
 
 
465 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 
456 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  27.11 
 
 
462 aa  125  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 
468 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  30.83 
 
 
543 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.56 
 
 
471 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 
486 aa  124  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 
501 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 
467 aa  123  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 
539 aa  123  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 
463 aa  123  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  28.51 
 
 
525 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  30.52 
 
 
480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  29.87 
 
 
492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 
443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  31.83 
 
 
500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 
495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  26.85 
 
 
503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  29.83 
 
 
480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  27.72 
 
 
465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  30.32 
 
 
466 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  29.81 
 
 
431 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  29.49 
 
 
468 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  29.49 
 
 
468 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  29.49 
 
 
468 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>