More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2384 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  73.3 
 
 		 525 aa  757    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 518 aa  1027    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  72.87 
 
 		 539 aa  708    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2567  amino acid permease-associated region  69.25 
 
 		 507 aa  615  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  57.62 
 
 		 481 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  46.65 
 
 		 543 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  45.38 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  45.78 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  45.71 
 
 		 475 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  44.79 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  45.35 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  47.45 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  42.8 
 
 		 549 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  41.55 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  46.63 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  41.31 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  41.31 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  40.9 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  41.31 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  41.31 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  40.24 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  41.31 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  41.31 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  41.1 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  42.09 
 
 		 496 aa  362  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  42.09 
 
 		 496 aa  362  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  41.51 
 
 		 471 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  46.27 
 
 		 471 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  45.62 
 
 		 466 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  45 
 
 		 468 aa  356  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  44.62 
 
 		 496 aa  356  5.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  45.18 
 
 		 466 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  45.42 
 
 		 466 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  45.62 
 
 		 476 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  45 
 
 		 468 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  45 
 
 		 468 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  40.5 
 
 		 500 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  45 
 
 		 468 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  38.2 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  38.2 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  38.2 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  40.94 
 
 		 506 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  42.16 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  42.49 
 
 		 496 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  43.93 
 
 		 495 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  40.77 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  40.78 
 
 		 489 aa  350  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  38.2 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  40.55 
 
 		 496 aa  349  7e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  43.54 
 
 		 482 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  42.97 
 
 		 469 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  44.29 
 
 		 465 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  45.18 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  45.18 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  45.18 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  41.51 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  41.51 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  43.46 
 
 		 466 aa  345  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  44.98 
 
 		 467 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  44.98 
 
 		 467 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  44.98 
 
 		 467 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  44.98 
 
 		 467 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  42.38 
 
 		 471 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  38.4 
 
 		 471 aa  342  7e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  38.2 
 
 		 471 aa  342  7e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  43.64 
 
 		 465 aa  342  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  38 
 
 		 471 aa  342  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  38.2 
 
 		 471 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  42.38 
 
 		 471 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  44.98 
 
 		 467 aa  342  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  42.26 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  43.75 
 
 		 517 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  42.26 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  37.8 
 
 		 471 aa  340  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  40.28 
 
 		 566 aa  340  5e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  42.19 
 
 		 486 aa  339  7e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  41.13 
 
 		 467 aa  339  8e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  44.02 
 
 		 463 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  41.43 
 
 		 490 aa  338  9e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  41.82 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  40.93 
 
 		 467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  41.16 
 
 		 467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  43.31 
 
 		 489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  40.93 
 
 		 467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  41.37 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  40.93 
 
 		 467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  40.88 
 
 		 463 aa  337  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  45.12 
 
 		 481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  43.6 
 
 		 492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  40.88 
 
 		 463 aa  337  5e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  44.02 
 
 		 486 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  42.27 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  41.7 
 
 		 463 aa  334  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  41.41 
 
 		 467 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  41.86 
 
 		 467 aa  333  6e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1704  amino acid permease-associated region  44.35 
 
 		 465 aa  332  8e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 518 aa  332  8e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  39.13 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  41.16 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  41.51 
 
 		 460 aa  330  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>