More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4824 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 641 aa  1259    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  42.07 
 
 		 725 aa  349  7e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  47.29 
 
 		 716 aa  345  2e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  40.3 
 
 		 773 aa  300  5e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  39.61 
 
 		 465 aa  293  5e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  41.91 
 
 		 740 aa  291  3e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  37.12 
 
 		 770 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  35.56 
 
 		 786 aa  265  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  36.24 
 
 		 753 aa  263  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  35.93 
 
 		 764 aa  261  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  35.5 
 
 		 745 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  33.68 
 
 		 820 aa  220  7e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  33.04 
 
 		 474 aa  208  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  34.53 
 
 		 473 aa  206  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  32.24 
 
 		 792 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  32.88 
 
 		 479 aa  184  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  33.11 
 
 		 475 aa  180  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.76 
 
 		 489 aa  143  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 476 aa  135  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 518 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 471 aa  127  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  29.21 
 
 		 500 aa  125  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.96 
 
 		 471 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 490 aa  124  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 503 aa  124  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.02 
 
 		 471 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.02 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.9 
 
 		 476 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 471 aa  122  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.02 
 
 		 471 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  28.29 
 
 		 476 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.8 
 
 		 471 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.8 
 
 		 471 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.8 
 
 		 471 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.8 
 
 		 471 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.8 
 
 		 471 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.98 
 
 		 486 aa  120  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  27.4 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 		 495 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  27.47 
 
 		 476 aa  117  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 		 506 aa  117  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  27.02 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  29.82 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 495 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 		 500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.06 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.04 
 
 		 471 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  26.04 
 
 		 471 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 465 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 494 aa  113  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  28.01 
 
 		 497 aa  113  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 		 481 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 538 aa  113  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.43 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 493 aa  112  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  26.04 
 
 		 471 aa  112  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  26.04 
 
 		 471 aa  112  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  29.64 
 
 		 504 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 482 aa  112  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 482 aa  112  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  28.29 
 
 		 481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  24.45 
 
 		 467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  24.67 
 
 		 467 aa  111  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  25.45 
 
 		 473 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 		 481 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 		 503 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  28.25 
 
 		 517 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 456 aa  110  7.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  24.67 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.67 
 
 		 467 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.06 
 
 		 463 aa  110  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.67 
 
 		 467 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  25.18 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.38 
 
 		 471 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  24.67 
 
 		 467 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  25.18 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  25.18 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.38 
 
 		 471 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.38 
 
 		 471 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 469 aa  110  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 496 aa  110  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  24.67 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  25.18 
 
 		 473 aa  109  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  24.83 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  25.18 
 
 		 473 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  26.49 
 
 		 462 aa  109  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  27.46 
 
 		 465 aa  108  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  26.86 
 
 		 474 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  24.94 
 
 		 473 aa  108  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  32.26 
 
 		 441 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  25 
 
 		 473 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3585  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 764 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236231 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  24.77 
 
 		 475 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  24.77 
 
 		 475 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>