More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3585 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3585  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 764 aa  1488    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236231 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 786 aa  190  8e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 		 770 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 745 aa  170  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  22.78 
 
 		 820 aa  156  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 		 716 aa  154  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 764 aa  153  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  31.87 
 
 		 475 aa  151  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  25.03 
 
 		 792 aa  147  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  23.54 
 
 		 753 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 773 aa  141  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  28.03 
 
 		 471 aa  138  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  30.58 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  30.33 
 
 		 474 aa  135  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  29.81 
 
 		 486 aa  135  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  28.81 
 
 		 471 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 		 473 aa  134  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 796 aa  134  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  28.22 
 
 		 471 aa  134  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  28.22 
 
 		 471 aa  134  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  28.22 
 
 		 471 aa  134  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  30.92 
 
 		 725 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 471 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  30.89 
 
 		 479 aa  130  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  27.72 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  27.93 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  27.93 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  27.93 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1905  amino acid permease-associated region  27.28 
 
 		 812 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  30.59 
 
 		 489 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.72 
 
 		 467 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  27.72 
 
 		 467 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  28.67 
 
 		 471 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 		 490 aa  128  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.93 
 
 		 471 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.93 
 
 		 471 aa  128  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.93 
 
 		 471 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.93 
 
 		 471 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.93 
 
 		 471 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.93 
 
 		 471 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.93 
 
 		 471 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  28.39 
 
 		 471 aa  127  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  28.67 
 
 		 471 aa  127  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.93 
 
 		 467 aa  126  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  29.71 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  28.06 
 
 		 471 aa  126  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  28.22 
 
 		 471 aa  126  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 495 aa  125  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  28.22 
 
 		 471 aa  125  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 494 aa  125  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  32.28 
 
 		 473 aa  125  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  30.05 
 
 		 538 aa  125  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4823  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 563 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 467 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  27.81 
 
 		 467 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 		 740 aa  123  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1055  amino acid permease-associated region  29.7 
 
 		 427 aa  123  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123493  hitchhiker  0.0000000766356 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  27.93 
 
 		 467 aa  122  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  30.96 
 
 		 433 aa  120  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  28.54 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  28.94 
 
 		 471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  28.94 
 
 		 471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  28.21 
 
 		 471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 		 439 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  28.63 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  28.72 
 
 		 500 aa  118  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  29.46 
 
 		 539 aa  117  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 549 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.13 
 
 		 466 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.13 
 
 		 466 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 641 aa  117  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  28.31 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  28.31 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  29.78 
 
 		 474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  27.91 
 
 		 468 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 		 468 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  27.56 
 
 		 481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  27.91 
 
 		 468 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  29.53 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  28.42 
 
 		 471 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  24.72 
 
 		 542 aa  115  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.31 
 
 		 468 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 		 463 aa  115  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 429 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 488 aa  114  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 		 491 aa  114  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 		 466 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 		 500 aa  113  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  30.24 
 
 		 518 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  31.39 
 
 		 481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  28.47 
 
 		 483 aa  112  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  29.87 
 
 		 491 aa  111  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  28.98 
 
 		 525 aa  111  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>