More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCZK0554 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  64.52 
 
 
473 aa  645    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  64.3 
 
 
473 aa  642    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  64.52 
 
 
473 aa  644    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  64.39 
 
 
474 aa  645    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  63.46 
 
 
473 aa  643    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  98.52 
 
 
473 aa  939    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  64.18 
 
 
513 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  64.52 
 
 
473 aa  645    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  97.89 
 
 
475 aa  903    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  63.07 
 
 
478 aa  635    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  64.73 
 
 
473 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  98.94 
 
 
473 aa  942    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  63.87 
 
 
476 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  63.5 
 
 
478 aa  640    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  64.52 
 
 
473 aa  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  100 
 
 
473 aa  951    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  64.36 
 
 
474 aa  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  98.32 
 
 
475 aa  907    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  64.09 
 
 
473 aa  642    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  64.73 
 
 
474 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  98.32 
 
 
475 aa  907    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  98.74 
 
 
475 aa  911    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  94.7 
 
 
472 aa  907    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  96.22 
 
 
476 aa  900    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  64.52 
 
 
473 aa  645    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  97.89 
 
 
475 aa  903    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  92.16 
 
 
472 aa  881    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  63.07 
 
 
474 aa  635    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  65.78 
 
 
474 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  63.5 
 
 
474 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  63.52 
 
 
471 aa  632  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  62.85 
 
 
472 aa  634  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  63.52 
 
 
471 aa  632  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  63.52 
 
 
468 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  61.47 
 
 
470 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  54.99 
 
 
468 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  55.9 
 
 
469 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  54.55 
 
 
468 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  54.55 
 
 
468 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  54.22 
 
 
470 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  54 
 
 
470 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  52.6 
 
 
474 aa  513  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  53.03 
 
 
467 aa  505  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  52.43 
 
 
469 aa  505  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  51.61 
 
 
479 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  51.43 
 
 
477 aa  501  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  54.24 
 
 
458 aa  502  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  51.61 
 
 
479 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  52.44 
 
 
485 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  51.53 
 
 
470 aa  501  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  51.1 
 
 
470 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  50.22 
 
 
475 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  51.28 
 
 
524 aa  492  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1306  amino acid permease  53.45 
 
 
458 aa  484  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000234157  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  47.9 
 
 
466 aa  462  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  48.67 
 
 
462 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01794  S-methylmethionine transporter  46.51 
 
 
465 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  42.92 
 
 
489 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  42.7 
 
 
489 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 
490 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  41.1 
 
 
527 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  42 
 
 
500 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  42.41 
 
 
489 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  42.65 
 
 
488 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  41.72 
 
 
526 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  42.46 
 
 
488 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  41.98 
 
 
487 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  42.24 
 
 
488 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  42.46 
 
 
488 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  42.24 
 
 
488 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  42.33 
 
 
526 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  42.3 
 
 
526 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  41.89 
 
 
526 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0831  amino-acid permease RocC  60.78 
 
 
297 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  41.89 
 
 
526 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  41.89 
 
 
526 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  42.46 
 
 
488 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  41.98 
 
 
487 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  41.1 
 
 
514 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  42.62 
 
 
520 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  42.06 
 
 
489 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  42.24 
 
 
488 aa  372  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  42.24 
 
 
488 aa  372  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  42.62 
 
 
520 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  42.62 
 
 
520 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  42.62 
 
 
520 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  42.62 
 
 
520 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  42.06 
 
 
489 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  42.06 
 
 
489 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  42.03 
 
 
488 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  42.62 
 
 
520 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  41.89 
 
 
511 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  42.62 
 
 
520 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  42.06 
 
 
489 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  42.24 
 
 
488 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  42.06 
 
 
489 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  41.89 
 
 
536 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  41.34 
 
 
489 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  42.09 
 
 
503 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  41.34 
 
 
489 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>