More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0746 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  56.71 
 
 		 725 aa  696    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 716 aa  1412    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  45.53 
 
 		 740 aa  571  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  43.19 
 
 		 773 aa  545  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  49.66 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  36.1 
 
 		 770 aa  342  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  35.02 
 
 		 764 aa  340  4e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  47.29 
 
 		 641 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  32.02 
 
 		 753 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  35.6 
 
 		 786 aa  333  7.000000000000001e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  32.5 
 
 		 745 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  32.19 
 
 		 820 aa  299  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  34.57 
 
 		 792 aa  266  8.999999999999999e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  36.01 
 
 		 473 aa  223  9e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  34.9 
 
 		 474 aa  201  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  34.32 
 
 		 475 aa  197  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  34.79 
 
 		 479 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  32.57 
 
 		 476 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  31.52 
 
 		 476 aa  180  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  31.84 
 
 		 476 aa  177  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  29.19 
 
 		 489 aa  168  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 486 aa  164  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  31.63 
 
 		 494 aa  163  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 495 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 		 506 aa  160  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 796 aa  156  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  31.12 
 
 		 465 aa  156  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 		 471 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  28.42 
 
 		 471 aa  154  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  28.42 
 
 		 471 aa  153  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  28.42 
 
 		 471 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  28.42 
 
 		 471 aa  153  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  28.42 
 
 		 471 aa  153  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  28.42 
 
 		 471 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  29.53 
 
 		 469 aa  153  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 		 500 aa  153  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  28.42 
 
 		 471 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 481 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 518 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  29.4 
 
 		 471 aa  152  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 494 aa  152  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  28.71 
 
 		 460 aa  152  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  28.09 
 
 		 471 aa  151  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  28.44 
 
 		 525 aa  151  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  31.65 
 
 		 543 aa  150  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  30.62 
 
 		 465 aa  150  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  29.37 
 
 		 495 aa  150  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  30.23 
 
 		 478 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  30.15 
 
 		 480 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  30.16 
 
 		 518 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  28.31 
 
 		 471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 		 488 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  28.31 
 
 		 471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 		 496 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 		 496 aa  148  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 485 aa  147  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  27.1 
 
 		 471 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  28.54 
 
 		 471 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  28.31 
 
 		 471 aa  147  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  29.77 
 
 		 497 aa  147  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 466 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 466 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  33.65 
 
 		 423 aa  146  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  26.88 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.64 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 539 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  26.88 
 
 		 463 aa  145  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 549 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  31.17 
 
 		 466 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  29.78 
 
 		 480 aa  144  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  29.4 
 
 		 481 aa  144  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  30.31 
 
 		 475 aa  144  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  26.21 
 
 		 460 aa  143  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1905  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 812 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  28.92 
 
 		 495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  28.94 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  29.74 
 
 		 465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  28.94 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  27.82 
 
 		 471 aa  142  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  28.07 
 
 		 456 aa  141  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 466 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.68 
 
 		 467 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  26.68 
 
 		 467 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.8 
 
 		 467 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.58 
 
 		 467 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  26.56 
 
 		 467 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  26.56 
 
 		 467 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 		 504 aa  140  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  26.56 
 
 		 467 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.35 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 538 aa  140  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.13 
 
 		 467 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.13 
 
 		 467 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.13 
 
 		 467 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>