More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2292 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 418 aa  803    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  55.29 
 
 		 427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  55.11 
 
 		 419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  52.27 
 
 		 440 aa  300  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  47.63 
 
 		 423 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  53.65 
 
 		 420 aa  293  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  50.25 
 
 		 421 aa  286  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  55.58 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  52.9 
 
 		 408 aa  279  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  54.29 
 
 		 415 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  54.29 
 
 		 415 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  54.29 
 
 		 415 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  52.36 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  50.63 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  52.29 
 
 		 459 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  52.44 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  51.41 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  50.25 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  48.66 
 
 		 407 aa  236  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  41.77 
 
 		 433 aa  229  8e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  37.18 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  47.84 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  36.32 
 
 		 437 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  36.62 
 
 		 431 aa  190  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  36.38 
 
 		 431 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 439 aa  142  9e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  29.18 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  30.25 
 
 		 436 aa  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 449 aa  126  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  34.26 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  31.9 
 
 		 792 aa  122  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 518 aa  122  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  28.9 
 
 		 641 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  31.81 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  26.59 
 
 		 463 aa  119  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  28.89 
 
 		 725 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  26.65 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 786 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1055  amino acid permease-associated region  30.64 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123493  hitchhiker  0.0000000766356 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 764 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  29.48 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 		 716 aa  113  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  29.12 
 
 		 491 aa  113  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  33.86 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 506 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  26.7 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 770 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  27.09 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  27.09 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.09 
 
 		 489 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 		 464 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  32.96 
 
 		 820 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  30.48 
 
 		 488 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.84 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  27.09 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.84 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  29.38 
 
 		 753 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.84 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  33.2 
 
 		 773 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 520 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.58 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 515 aa  106  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.91 
 
 		 467 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  31.02 
 
 		 515 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 481 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  29.49 
 
 		 499 aa  104  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 471 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 467 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  28.86 
 
 		 467 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  29.43 
 
 		 740 aa  103  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  26.05 
 
 		 542 aa  103  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 		 494 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 453 aa  102  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  25.89 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 		 503 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  25.94 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  29.15 
 
 		 481 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 495 aa  99.8  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 745 aa  99.8  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 		 455 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  32.93 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 462 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 462 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  30.13 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 462 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  32.22 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  23.99 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  23.99 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  23.99 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 485 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  25.96 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  23.99 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>