More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0097 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  100 
 
 
433 aa  854    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  57.14 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  56.18 
 
 
441 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  57.14 
 
 
431 aa  408  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  55.61 
 
 
437 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  41.77 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  36.51 
 
 
423 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  38.48 
 
 
419 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  37.35 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  35.41 
 
 
440 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  38.44 
 
 
408 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  37.58 
 
 
428 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  33.73 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  34.79 
 
 
420 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  33.95 
 
 
423 aa  166  8e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 
439 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  36.39 
 
 
438 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.03 
 
 
489 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  35.51 
 
 
430 aa  157  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  28.92 
 
 
449 aa  156  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  32.19 
 
 
436 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  38.05 
 
 
459 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  37.2 
 
 
408 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
494 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  37.44 
 
 
415 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  37.44 
 
 
415 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  37.44 
 
 
415 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  28.6 
 
 
422 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.89 
 
 
471 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  31.02 
 
 
486 aa  143  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.66 
 
 
471 aa  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.66 
 
 
471 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.66 
 
 
471 aa  143  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.66 
 
 
471 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.66 
 
 
471 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  32.09 
 
 
467 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.66 
 
 
471 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  32.09 
 
 
467 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  28.15 
 
 
471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  32.09 
 
 
467 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  32.12 
 
 
467 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  32.12 
 
 
467 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  29.01 
 
 
467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  32.09 
 
 
467 aa  140  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  32.09 
 
 
467 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  32.09 
 
 
467 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  34.78 
 
 
418 aa  139  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 
495 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  29.97 
 
 
491 aa  139  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 
538 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 
471 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.66 
 
 
471 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 
500 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  32.4 
 
 
467 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.89 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 
510 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 
492 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 
476 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  37.15 
 
 
443 aa  136  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  27 
 
 
542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  27.32 
 
 
463 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 
495 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  28.32 
 
 
500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  26.95 
 
 
463 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  29.95 
 
 
455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  31.05 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  29.75 
 
 
474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 
518 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 
456 aa  130  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 
494 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.98 
 
 
471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.98 
 
 
471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 
496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 
495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  27.27 
 
 
483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  29.64 
 
 
506 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 
475 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 
481 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.52 
 
 
471 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.29 
 
 
471 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 
485 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  26.74 
 
 
471 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 
468 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  28.67 
 
 
480 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 
468 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 
468 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  32.02 
 
 
473 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  28.05 
 
 
440 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 
491 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 
468 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.77 
 
 
471 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.77 
 
 
471 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.77 
 
 
471 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 
480 aa  124  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 
491 aa  123  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 
518 aa  123  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  31.29 
 
 
433 aa  123  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.87 
 
 
468 aa  123  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 
466 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>