More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0048 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  98.38 
 
 
431 aa  835    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  848    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  65.96 
 
 
441 aa  529  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  65.49 
 
 
437 aa  510  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  57.14 
 
 
433 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  38.19 
 
 
423 aa  189  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  37.44 
 
 
427 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  37.71 
 
 
419 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  37.31 
 
 
418 aa  176  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  34.98 
 
 
440 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  37.53 
 
 
420 aa  167  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  37.03 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  29.03 
 
 
489 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  36.04 
 
 
408 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  31.41 
 
 
436 aa  156  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  30.48 
 
 
449 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  31.95 
 
 
471 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  32.41 
 
 
471 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  31.95 
 
 
471 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  32.19 
 
 
471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  32.19 
 
 
471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  32.19 
 
 
471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  32.19 
 
 
471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  32.19 
 
 
471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  32.18 
 
 
471 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 
439 aa  151  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  29.65 
 
 
467 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  35.7 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  36.77 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  30.65 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  37.83 
 
 
415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  37.83 
 
 
415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  37.83 
 
 
415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  29.65 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  29.32 
 
 
467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  31.79 
 
 
471 aa  147  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.73 
 
 
467 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.73 
 
 
467 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  31.53 
 
 
471 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  29.1 
 
 
467 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  30.42 
 
 
475 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  31.08 
 
 
471 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  30.58 
 
 
467 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  31.08 
 
 
471 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  29.1 
 
 
467 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  29.1 
 
 
467 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 
494 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  29.1 
 
 
467 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 
459 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  29.3 
 
 
740 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  29.42 
 
 
495 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 
510 aa  143  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  32.73 
 
 
716 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  30.16 
 
 
471 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  35.9 
 
 
408 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 
495 aa  142  9e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  31.58 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  29.28 
 
 
495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  30.66 
 
 
471 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  30.66 
 
 
471 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  30.66 
 
 
471 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 
486 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  31.54 
 
 
491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  28.54 
 
 
543 aa  137  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  36.54 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  28.3 
 
 
497 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  29.56 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  29.24 
 
 
476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  28.94 
 
 
494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  31.93 
 
 
773 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  30.41 
 
 
468 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  28.35 
 
 
542 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  29.78 
 
 
786 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  29.64 
 
 
506 aa  134  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  30.89 
 
 
471 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  27.96 
 
 
463 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0408  amino acid permease-associated region  30 
 
 
410 aa  133  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  30.66 
 
 
471 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  30.66 
 
 
471 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  28.25 
 
 
480 aa  133  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 
490 aa  132  7.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  30.89 
 
 
471 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  30.66 
 
 
471 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  32.09 
 
 
492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  29.39 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  27.96 
 
 
463 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  29.72 
 
 
518 aa  130  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 
463 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  30.42 
 
 
486 aa  129  8.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  29.49 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  37.35 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  29.13 
 
 
478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  28.64 
 
 
476 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 
549 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  37.4 
 
 
428 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  29.21 
 
 
476 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 
456 aa  127  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  29.61 
 
 
491 aa  127  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.69 
 
 
422 aa  126  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  27.25 
 
 
525 aa  126  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>