More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0187 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  100 
 
 
408 aa  763    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  82.84 
 
 
408 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  71.82 
 
 
440 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  72.17 
 
 
415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  72.17 
 
 
415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  72.17 
 
 
415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  63.37 
 
 
421 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  57.32 
 
 
423 aa  346  4e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  61.46 
 
 
419 aa  346  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  67.98 
 
 
411 aa  345  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  59.35 
 
 
427 aa  342  9e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  63.48 
 
 
459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  61.56 
 
 
407 aa  317  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  52.97 
 
 
418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  56.39 
 
 
420 aa  301  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  57.66 
 
 
428 aa  296  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  58.69 
 
 
438 aa  282  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  54.57 
 
 
418 aa  266  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  51.52 
 
 
430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  53.66 
 
 
443 aa  243  5e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  41.29 
 
 
433 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  36.45 
 
 
441 aa  201  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  35.97 
 
 
431 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4639  amino acid permease-associated region  65.87 
 
 
441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  36.04 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  41.48 
 
 
427 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  30.83 
 
 
449 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  32.17 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.41 
 
 
489 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  31.2 
 
 
436 aa  136  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  30.96 
 
 
518 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  32.42 
 
 
770 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  30.34 
 
 
745 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 
500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 
494 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.54 
 
 
422 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 
439 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 
476 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  25.28 
 
 
542 aa  129  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  29.52 
 
 
520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.68 
 
 
471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.68 
 
 
471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.68 
 
 
471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.68 
 
 
471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.68 
 
 
471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 
786 aa  127  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.2 
 
 
471 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.44 
 
 
471 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 
510 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.64 
 
 
471 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.24 
 
 
471 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.24 
 
 
471 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 
486 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.24 
 
 
471 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 
515 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  33.71 
 
 
423 aa  122  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  32.27 
 
 
515 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  29.13 
 
 
492 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.92 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 
495 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.42 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 
488 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 
495 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 
490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  26.96 
 
 
463 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  26.96 
 
 
463 aa  119  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 
456 aa  119  9e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 
549 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  31.97 
 
 
773 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  26.48 
 
 
525 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 
506 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  27.5 
 
 
512 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4823  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 
563 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  27.02 
 
 
513 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  26 
 
 
478 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 
764 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 
481 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 
792 aa  116  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 
465 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  29.18 
 
 
483 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  31.66 
 
 
753 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  24.76 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  32.49 
 
 
725 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  31.14 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  30 
 
 
500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 
495 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  27 
 
 
466 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  27.46 
 
 
463 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  24.76 
 
 
471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  30 
 
 
465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  28.1 
 
 
486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 
481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  28.1 
 
 
486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 
494 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3470  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 
561 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0308593  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>